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Enregistrement W3144365585 · doi:10.1101/2021.04.08.439013

Snazarus and its human ortholog SNX25 regulate autophagic flux by affecting VAMP8 endocytosis

2021· preprint· en· W3144365585 sur OpenAlexafffund
Annie Lauzier, Marie-France Bossanyi, Rupali Ugrankar, W. Mike Henne, Steve Jean

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de Sherbrooke
Mots-clésSorting nexinAutophagyCell biologyEndocytosisBiologyLysosomeFlux (metallurgy)EndosomeChemistryCellIntracellularApoptosisBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Autophagy, the degradation and recycling of cytosolic components in the lysosome, is an essential cellular mechanism. It is a membrane-mediated process that is linked to vesicular trafficking events. The sorting nexin (SNX) protein family controls the sorting of a large array of cargoes, and various SNXs can impact autophagy. To gain a better understanding of their functions in vivo under nutrient starvation, we screened all Drosophila SNXs by RNAi in the fat body. Significantly, depletion of snazarus ( snz ) strongly impacted autolysosome formation and led to decreased autophagic flux. Interestingly, we observed altered distribution of Vamp7-positive vesicles with snz depletion and snz roles were conserved in human cells. SNX25 is the closest ortholog to snz , and we demonstrate a role for it in VAMP8 trafficking. We found that this activity was dependent on the SNX25 PX domain, and independent of SNX25 anchoring at the ER. We also demonstrate that differentially spliced forms of SNX14 and SNX25 are present in cancer cells. This work identifies a conserved role for snz / SNX25 as regulators of autophagic flux, and show differential isoform expression between orthologs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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