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Enregistrement W3145266556 · doi:10.1094/phytofr-10-20-0023-r

Isolation and Characterization of <i>Bacillus velezensis</i> EB14, an Endophytic Bacterial Strain Antagonistic to Poplar Stem Canker Pathogen <i>Sphaerulina musiva</i> and Its Interactions with the Endophytic Fungal Microbiome in Poplar

2021· article· en· W3145266556 sur OpenAlexaff
Sachin Naik, Sylvester Palys, Marcos Di Falco, Adrian Tsang, Pierre Périnet, Uma Shaanker Ramanan, Selvadurai Dayanandan

Notice bibliographique

RevuePhytoFrontiers™ · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensMinistère des Ressources naturelles et des ForêtsConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCankerPlant use of endophytic fungi in defenseEndophyteBotanyStrain (injury)MicrobiomeFungal pathogenBiological pest controlPathogenMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Species of the genus Populus (commonly known as poplar) are one of the most widely used groups of forest trees in North America and Europe, and play a significant ecological role as a pioneer species in boreal forests and as a dominant species in the riparian forests that serve as wildlife habitats and watersheds. Natural and artificial hybrids of poplar are being extensively used in commercial plantations. However, many hybrid poplar trees are susceptible to Sphaerulina musiva, the pathogenic fungus that causes leaf spots and stem cankers and limits the utility of hybrid poplar as a plantation tree. We isolated an endophytic bacterial strain, Bacillus velezensis EB14, from a Populus hybrid which showed a strong antifungal activity against S. musiva. Through mass spectrometric analyses of cocultured B. velezensis EB14 and S. musiva, we identified five cyclic lipopeptides produced by B. velezensis EB14: iturin A1, iturin A2, iturin A9, subtulene A, and fengycin. In addition, B. velezensis EB14 produced four major unidentified compounds in cocultivation with S. musiva. The cyclopeptide production by B. velezensis EB14 was more pronounced (20- to 1,000-fold) in the cocultured plates due to elicitation by S. musiva. We also discovered that the native endophytic B. velezensis EB14 strain exhibited different levels of interactions against the endophytic fungal microbiomes of Populus sp. Overall, our results indicate that B. velezensis EB14 strain as a promising biocontrol agent that could be used against stem canker and leaf spot diseases caused by S. musiva in poplar plantations. [Formula: see text] Copyright © 2021 The Author(s). This is an open access article distributed under the CC BY-NC-ND 4.0 International license .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,483
Score d'incertitude au seuil0,401

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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