Increased household secondary attacks rates with Variant of Concern SARS-CoV-2 index cases
Notice bibliographique
Résumé
Abstract IMPORTANCE Higher secondary attack rates related to variant of concern (VOC) index cases have been reported, but have not been explored within households, which continue to be an important source of coronavirus disease 2019 (COVID-19) transmission OBJECTIVE To compare secondary attack rates in households with VOC versus non-VOC index cases. DESIGN A retrospective cohort study of household index cases reported from February 7 – 27, 2021. A propensity-score matched cohort was derived to calculate adjusted estimates. SETTING Ontario, Canada. PARTICIPANTS A population-based cohort of all private households with index cases. We excluded cases in congregate settings, as well as households with one individual or with >1 case with the same earliest symptom onset date. EXPOSURE VOC status, defined as either individuals confirmed as B.1.1.7 using whole genome sequencing or those that screened positive for the N501Y mutation using real-time PCR. MAIN OUTCOME AND MEASURE Household secondary attack rate, defined as the number of household secondary cases that occurred 1-14 days after the index case divided by the total number of household secondary contacts. RESULTS We included 1,259 index VOC and non-VOC cases in the propensity score-matched analysis. The secondary attack rate for VOC index cases in this matched cohort was 1.31 times higher than non-VOC index cases (RR=1.31, 95%CI 1.14-1.49), similar to the unadjusted estimate. In stratified analyses, the higher secondary attack rate for VOC compared to non-VOC index cases was accentuated for asymptomatic index cases (RR=1.91, 95% CI 0.96-3.80) and presymptomatic cases (RR=3.41, 95%CI 1.13-10.26) CONCLUSIONS AND RELEVANCE This study provides strong evidence of increased transmissibility in households due to VOCs and suggests that asymptomatic and pre-symptomatic transmission may be of particular importance for VOCs. Our study suggests that more aggressive public health measures will be needed to control VOCs and that ongoing research is needed to understand mechanisms of VOC transmissibility to curb their associated morbidity and mortality.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».