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Enregistrement W3146052998

Microbial Iron Geochemistry of a Pristine Glaciofluvial Groundwater System

2015· dissertation· en· W3146052998 sur OpenAlexfundno aff
V. Shirokova

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGroundwaterGeochemistryGeologyMicrobiologyBiologyGeotechnical engineering
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The biogeochemical cycling of iron by microorganisms has a strong impact on groundwater resources due to their influence on aqueous geochemistry, including contaminant mobility. This thesis expands on knowledge of groundwater-surface transitions through the characterization of an iron cycling biofilm dominated groundwater spring, and presents the first in situ investigation of microbial iron cycling in a pristine, glaciofluvial aquifer that has not been used as a groundwater resource, anthropogenically contaminated, or stimulated to enhance microbial activity. Metagenomic evidence from the groundwater spring with a sharp reduction-oxidation gradient demonstrated the presence of iron biofilm forming microbes in the groundwater system being studied, as well as showing a diversity of nitrogen and sulfur cycling microorganisms. Changes in redox potential along the length of the stream corresponded with pronounced shifts in the relative abundance of bacteria known to mediate the biogeochemical cycling of iron, sulfur, and nitrogen. Five years of geochemical surveying showed a spatiotemporally persistent zone of elevated iron concentrations in an aquifer which had previously been shown to have potential for microbial iron cycling through genomic characterization. Based on the analysis of terminal electron acceptor concentrations in the groundwater, the aquifer was found to be graded into zones of O2 reduction, NO3- reduction, Fe3+ reduction, oxygen-dependent Fe2+ oxidation, and nitrate-dependent Fe2+ oxidation. Hydrogeological and geophysical evidence suggested that groundwater flow conditions differed in the vicinity of the elevated iron zone, which may have contributed to conditions conducive to the growth of a subsurface microbial community. Environmental electron scanning microscopy showed bacterial morphologies similar to known iron cycling bacteria were present in the elevated iron zone, but not outside of it. The findings of this thesis are broadly applicable to other aquifers of glacial and glaciofluvial origin, where reducing conditions will arise through non-aerobic forms of microbial respiration, and observed patterns of redox zonation will be affected by the mixing of groundwater along three dimensional flow paths. Taken together, this thesis underscores the importance of iterative interdisciplinary collaboration, including hydrogeology, geochemistry, near-surface geophysics, and microbiology, as a means of building the most complete possible representations of groundwater resources.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,032

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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