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Enregistrement W3146487546 · doi:10.1002/leg3.91

Yield and antiyield genes in common bean (<scp><i>Phaseolus vulgaris</i></scp>L.)

2021· article· en· W3146487546 sur OpenAlexafffundabout
Yarmilla Reinprecht, Yanzhou Qi, Fariba Shahmir, Thomas H. Smith, K. Peter Pauls

Notice bibliographique

RevueLegume Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsUniversity of Guelph
Mots-clésPhaseolusBiologyGeneCultivarGeneticsYield (engineering)TraitHorticultureBiotechnologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract High yield is the primary criterion for the development of new cultivars at the University of Guelph common bean breeding program. As a complex trait, yield is encoded by a number of genes contributing minor effects while also being significantly affected by environmental factors. Genes that increase yield with fixed resources have their effects by increasing input use efficiency. When suppressed, theBnMicEmUPgene has a positive effect on seed production inArabidopsis. Preliminary work has shown that ortholog of this gene (Phvul.009G190100) exists in common bean, and its expression was negatively correlated with yield in a field test of 10 navy bean cultivars with different yield potentials. The aim of this research was to characterize thePhvul.009G190100gene and to develop gene‐based marker(s) to test for alleles associated with high yield in common bean. A database search identified a second yield‐related gene (Phvul.009G202100) on the same chromosome (Pv09), which is a homolog toPhvul.009G190100. Both genes contain a DUF1118 protein domain, which has the molecular characteristics of a basic leucine zipper (bZIP) transcription factor, based on in silico analysis. Temperature switch polymerase chain reaction (PCR) markers, which were developed for both genes, were significantly associated with yield and maturity in 42 bean genotypes belonging to different market classes. The work will benefit bean breeding programs by making them more efficient in selecting high yielding cultivars, and it will directly benefit bean producers through accelerated access to new, high yielding cultivars.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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