Yield and antiyield genes in common bean (<scp><i>Phaseolus vulgaris</i></scp>L.)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract High yield is the primary criterion for the development of new cultivars at the University of Guelph common bean breeding program. As a complex trait, yield is encoded by a number of genes contributing minor effects while also being significantly affected by environmental factors. Genes that increase yield with fixed resources have their effects by increasing input use efficiency. When suppressed, theBnMicEmUPgene has a positive effect on seed production inArabidopsis. Preliminary work has shown that ortholog of this gene (Phvul.009G190100) exists in common bean, and its expression was negatively correlated with yield in a field test of 10 navy bean cultivars with different yield potentials. The aim of this research was to characterize thePhvul.009G190100gene and to develop gene‐based marker(s) to test for alleles associated with high yield in common bean. A database search identified a second yield‐related gene (Phvul.009G202100) on the same chromosome (Pv09), which is a homolog toPhvul.009G190100. Both genes contain a DUF1118 protein domain, which has the molecular characteristics of a basic leucine zipper (bZIP) transcription factor, based on in silico analysis. Temperature switch polymerase chain reaction (PCR) markers, which were developed for both genes, were significantly associated with yield and maturity in 42 bean genotypes belonging to different market classes. The work will benefit bean breeding programs by making them more efficient in selecting high yielding cultivars, and it will directly benefit bean producers through accelerated access to new, high yielding cultivars.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».