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Enregistrement W3146557908 · doi:10.1093/brain/awab133

INPP5K and SIL1 associated pathologies with overlapping clinical phenotypes converge through dysregulation of PHGDH

2021· article· en· W3146557908 sur OpenAlexafffund
Denisa Hathazi, Dan Cox, Adele D’Amico, Giorgio Tasca, Richard Charlton, Robert‐Yves Carlier, J Baumann, Laxmikanth Kollipara, René P. Zahedi, Ingo Feldmann, Jean‐François Deleuze, Annalaura Torella, Ronald D. Cohn, Emily Robinson, Francesco Ricci, Heinz Jungbluth, Fabiana Fattori, Anne Boland, Emily O’Connor, Rita Horváth, Rita Barresi, Hanns Lochmüller, Andoni Urtizberea, Marie‐Line Jacquemont, Isabelle Nelson, Laura E. Swan, Gisèle Bonne, Andreas Roos

Notice bibliographique

RevueBrain · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensJewish General HospitalUniversity of OttawaUniversity of TorontoSickKids FoundationChildren's Hospital of Eastern OntarioMcGill University
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchLily FoundationEvelyn TrustCanada Research ChairsMinisterium für Kultur und Wissenschaft des Landes Nordrhein-WestfalenWellcome TrustAgence Nationale de la RechercheDeutsche ForschungsgemeinschaftAtaxia UKMuscular Dystrophy CanadaDeutsche Gesellschaft für MuskelkrankeNewton FundAction Medical ResearchFrench Muscular Dystrophy AssociationSorbonne UniversitéInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleCanada Foundation for InnovationMuscular Dystrophy Association
Mots-clésPhenotypeAtaxiaSerineGeneticsBiologyMedicineGeneNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Marinesco-Sjögren syndrome is a rare human disorder caused by biallelic mutations in SIL1 characterized by cataracts in infancy, myopathy and ataxia, symptoms which are also associated with a novel disorder caused by mutations in INPP5K. While these phenotypic similarities may suggest commonalties at a molecular level, an overlapping pathomechanism has not been established yet. In this study, we present six new INPP5K patients and expand the current mutational and phenotypical spectrum of the disease showing the clinical overlap between Marinesco-Sjögren syndrome and the INPP5K phenotype. We applied unbiased proteomic profiling on cells derived from Marinesco-Sjögren syndrome and INPP5K patients and identified alterations in d-3-PHGDH as a common molecular feature. d-3-PHGDH modulates the production of l-serine and mutations in this enzyme were previously associated with a neurological phenotype, which clinically overlaps with Marinesco-Sjögren syndrome and INPP5K disease. As l-serine administration represents a promising therapeutic strategy for d-3-PHGDH patients, we tested the effect of l-serine in generated sil1, phgdh and inpp5k a+b zebrafish models, which showed an improvement in their neuronal phenotype. Thus, our study defines a core phenotypical feature underpinning a key common molecular mechanism in three rare diseases and reveals a common and novel therapeutic target for these patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,261
Score d'incertitude au seuil0,280

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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