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Enregistrement W3146579488 · doi:10.1186/s12931-021-01694-z

Prognostic role of MUC5B rs35705950 genotype in patients with idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) on antifibrotic treatment

2021· article· en· W3146579488 sur OpenAlexaff
Davide Biondini, Elisabetta Cocconcelli, Nicol Bernardinello, Giulia Lorenzoni, Chiara Rigobello, Sara Lococo, G. Castelli, Simonetta Baraldo, Manuel G. Cosío, Darío Gregori, Marina Saetta, Elisabetta Balestro, Paolo Spagnolo

Notice bibliographique

RevueRespiratory Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Établissements canadiensMcGill UniversityChristie (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineIdiopathic pulmonary fibrosisInternal medicineGenotypeVital capacityAlleleLung transplantationPopulationOncologyTransplantationGastroenterologyLungBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A common variant located in the promoter region of MUC5B (rs35705950) is the strongest risk factor for sporadic and familiar IPF, as well as a predictor of outcome. However, there are no data on the effect of MUC5B rs35705950 genotype on the prognosis of IPF patients on antifibrotic treatment. The aim of this study is to determine, in a phenotypically well-characterized population of patients with IPF treated with antifibrotics, the impact of MUC5B rs35705950 genotype on disease progression and survival. METHODS: 88 IPF patients on antifibrotic treatment were followed-up from 2014 until transplantation, death or end of follow-up (December 2019). Disease progression was defined as a forced vital capacity (FVC) loss ≥ 5% per year. All patients were genotyped for MUC5B rs35705950 by PCR amplification and Sanger sequencing. RESULTS: Out of 88 patients, 61 (69%) carried the mutant T allele (TT or TG) and 27 (31%) did not (GG). Carriage of the MUC5B rs35705950 T allele was not associated with a faster decline in FVC. Conversely, at the end of the follow-up, overall survival in carriers of the TT/TG genotype was longer compared to that of the GG genotype carriers. FVC (L) at baseline and time to respiratory failure at rest were independent predictors of worse prognosis. CONCLUSIONS: In IPF patients on antifibrotic treatment, carriage of the MUC5B rs35705950 T allele is associated with longer survival, highlighting the usefulness of MUC5B genetic data in clinical decision making.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,867

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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