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Enregistrement W3148463658 · doi:10.1101/2021.03.27.435072

Th17 cell master transcription factor RORC2 regulates HIV-1 gene expression and viral outgrowth

2021· preprint· en· W3148463658 sur OpenAlexafffund
Tomas Raul Wiche Salinas, Yu-Wei Zhang, Daniele Sarnello, Alexander Zhyvoloup, Laurence Raymond Marchand, Delphine Planas, Manivel Lodha, Debashree Chatterjee, Kasia Karwacz, Sally Oxenford, Jean‐Pierre Routy, Heather Amrine‐Madsen, Petronela Ancuța, Ariberto Fassati

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensMcGill University Health CentreCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesThird Health ProgrammeMedical Research CouncilUniversité de MontréalCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University Health CentreMcGill UniversityCanadian Foundation for AIDS Research
Mots-clésBiologyViremiaRetinoic acidImmune systemViral replicationTranscription factorChromatinEnhancerProvirusJurkat cellsTranscriptional regulationT cellVirologyMolecular biologyCell biologyGeneImmunologyVirusGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Among CD4+ T-cells, T helper 17 (Th17) cells are particularly susceptible to HIV-1 infection and are depleted from mucosal sites, which causes damage to the gut barrier resulting in microbial translocation-induced systemic inflammation, a hallmark of disease progression. Furthermore, a proportion of latently infected Th17 cells persist long-term in the gastro-intestinal lymphatic tract, where low-level HIV-1 transcription is observed. This residual viremia contributes to chronic immune activation. Thus, Th17 cells are key players in HIV pathogenesis and viral persistence, however it is unclear why these cells are highly susceptible to HIV-1 infection. Th17 cell differentiation depends on expression of the master transcriptional regulator RORC2, a retinoic acid-related nuclear hormone receptor that regulates specific transcriptional programs by binding to promoter/enhancer DNA. Here, we report that RORC2 is a key host-cofactor for HIV replication in Th17 cells. We found that specific inhibitors that bind to the RORC2 ligand-binding domain reduced HIV replication in CD4+ T-cells. Depletion of RORC2 inhibited HIV-1 infection, whereas RORC2 overexpression enhanced it. RORC2 was found to promote HIV-1 gene expression. Chromatin immune precipitation revealed that RORC2 binds to the nuclear receptor responsive element (NRRE) in the HIV-1 LTR. In treated HIV-1 patients, RORC2+ CD4 T cells contained more proviral DNA than RORC2− cells. Pharmacological inhibition of RORC2 potently reduced HIV-1 outgrowth in CD4+ T-cells from antiretroviral-treated patients. Altogether, these results provide a new explanation as to why Th17 cells are highly susceptible to HIV-1 infection and point to RORC2 as a cell-specific target for HIV-1 therapy. Significance statement HIV-1 infects CD4 T cells and among these, Th17 cells are known to be particularly permissive for virus replication. Infection of Th17 cells is critical for AIDS pathogenesis and viral persistence, however it is not clear why these cells are highly permissive to HIV-1. We found that Th17 cell permissiveness depends on expression of the hormone receptor RORC2, which is the master transcriptional regulator of Th17 cell differentiation. We identify RORC2 as a new, cell-specific host-dependency factor that can be targeted by small molecules. Our results point to RORC2 as a cell-specific target for HIV-1 therapy, an entirely new concept in the field, and suggest HIV-1 might have evolved to exploit RORC2 to promote its own persistence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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