Fecal Bacterial Microbiota of Healthy Free-Ranging, Healthy Corralled, and Chronic Diarrheic Corralled Rhesus Macaques (<i>Macaca mulatta</i>)
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Notice bibliographique
Résumé
A clinical challenge to nearly every primate facility in North America is chronic idiopathic diarrhea (CID), the pathogenesis of which has yet to be fully elucidated. However, wild macaques appear resistant to CID, a trend that we observed in the free-ranging population of the Caribbean Primate Research Center. The gastrointestinal microbiota has been shown to have a significant role in the pathogenesis of disease and in maintaining normal health and development of the gut. In humans, chronic diarrhea is associated with alteration of the gut microbiota, which has lower bacterial diversity than does the microbiota of healthy humans. The current study was designed to describe and compare the fecal bacterial microbiota of healthy corralled, CID corralled, and healthy, free-ranging macaques. Fresh fecal samples were collected from healthy corralled (HC; n = 30) and CID ( n = 27) rhesus macaques and from healthy macaques from our free-ranging colony (HF; n = 43). We excluded macaques that had received antibiotics during the preceding 60 d (90 d for healthy animals). Bacterial DNA was extracted, and the V4 region of the 16S rRNA gene was sequenced and compared with known databases. The relative abundance of Proteobacteria was higher in CID animals than HC animals, but otherwise few differences were found between these 2 groups. HF macaques were differentially enriched with Christensenellaceae and Helicobacter , which are highly associated with a 'healthy' gut in humans, as compared to corralled animals, whereas CID animals were enriched with Proteobacteria, which are associated with dysbiosis in other species. These results indicate that environment has a greater influence than health status on the gut microbiota. Furthermore, the current data provided targets for future studies on potential clinical interventions, such as probiotics and fecal transplants.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle