Shared Metabolic Remodeling Processes Characterize the Transcriptome of <i>Arabidopsis thaliana</i> within Various Suborbital Flight Environments
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The increasing availability of flights on suborbital rockets creates new avenues for the study of spaceflight effects on biological systems, particularly of the transitions between hypergravity and microgravity. This paper presents an initial comparison of the responses of Arabidopsis thaliana to suborbital and atmospheric parabolic flights as an important step toward characterizing these emerging suborbital platforms and their effects on biology. Transcriptomic profiling of the response of the Arabidopsis ecotype Wassilewskija (WS) to the aggregate suborbital spaceflight experiences in Blue Origin New Shepard and Virgin Galactic SpaceShipTwo revealed that the transcriptomic load induced by flight differed between the two flights, yet was biologically related to traditional parabolic flight responses. The sku5 skewing mutant and 14-3-3κ:GFP regulatory protein overexpression lines, flown in the Blue Origin and parabolic flights, respectively, each showed altered intra-platform responses compared to WS. An additional parabolic flight using the F-104 Starfighter showed that the response of 14-3-3κ:GFP to flight was modulated in a similar manner to the WS line. Despite the differing genotypes, experimental workflows, flight profiles, and platforms, differential gene expression linked to remodeling of central metabolic processes was commonly observed in the flight responses. However, the timing and directionality of differentially expressed genes involved in the conserved processes differed among the platforms. The processes included carbon and nitrogen metabolism, branched-chain amino acid degradation, and hypoxic responses. The data presented herein highlight the potential for various suborbital platforms to contribute insights into biological responses to spaceflight, and further suggest that in-flight fixation during suborbital experiments will enhance insights into responses during each phase of flight.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».