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Enregistrement W3150202690 · doi:10.48550/arxiv.2103.16617

HAD-Net: A Hierarchical Adversarial Knowledge Distillation Network for Improved Enhanced Tumour Segmentation Without Post-Contrast Images

2021· preprint· en· W3150202690 sur OpenAlexaff
Saverio Vadacchino, Raghav Mehta, Nazanin Mohammadi Sepahvand, Brennan Nichyporuk, James J. Clark, Tal Arbel

Notice bibliographique

RevuearXiv (Cornell University) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAdvanced Neural Network Applications
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSegmentationComputer scienceArtificial intelligenceContext (archaeology)Modality (human–computer interaction)InferenceContrast (vision)DiceMachine learningPattern recognition (psychology)Mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Segmentation of enhancing tumours or lesions from MRI is important for detecting new disease activity in many clinical contexts. However, accurate segmentation requires the inclusion of medical images (e.g., T1 post contrast MRI) acquired after injecting patients with a contrast agent (e.g., Gadolinium), a process no longer thought to be safe. Although a number of modality-agnostic segmentation networks have been developed over the past few years, they have been met with limited success in the context of enhancing pathology segmentation. In this work, we present HAD-Net, a novel offline adversarial knowledge distillation (KD) technique, whereby a pre-trained teacher segmentation network, with access to all MRI sequences, teaches a student network, via hierarchical adversarial training, to better overcome the large domain shift presented when crucial images are absent during inference. In particular, we apply HAD-Net to the challenging task of enhancing tumour segmentation when access to post-contrast imaging is not available. The proposed network is trained and tested on the BraTS 2019 brain tumour segmentation challenge dataset, where it achieves performance improvements in the ranges of 16% - 26% over (a) recent modality-agnostic segmentation methods (U-HeMIS, U-HVED), (b) KD-Net adapted to this problem, (c) the pre-trained student network and (d) a non-hierarchical version of the network (AD-Net), in terms of Dice scores for enhancing tumour (ET). The network also shows improvements in tumour core (TC) Dice scores. Finally, the network outperforms both the baseline student network and AD-Net in terms of uncertainty quantification for enhancing tumour segmentation based on the BraTs 2019 uncertainty challenge metrics. Our code is publicly available at: https://github.com/SaverioVad/HAD_Net

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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