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Enregistrement W3150530058 · doi:10.3390/microorganisms9040738

Serotype Distribution of Remaining Pneumococcal Meningitis in the Mature PCV10/13 Period: Findings from the PSERENADE Project

2021· article· en· W3150530058 sur OpenAlexaff
Maria Garcia Quesada, Yangyupei Yang, Julia C. Bennett, Kyla Hayford, Scott L. Zeger, Daniel R. Feikin, Meagan E. Peterson, Adam L. Cohen, Samanta Cristine Grassi Almeida, Krow Ampofo, Michelle Ang, Naor Bar‐Zeev, Michael G. Bruce, Romina Camilli, Grettel Chanto Chacón, Pilar Ciruela, Cheryl Cohen, Mary Corcoran, Ron Dagan, Philippe De Wals, Stefanie Desmet, Idrissa Diawara, Ryan Gierke, Marcela Guevara, Laura L. Hammitt, Markus Hilty, Pak‐Leung Ho, Sanjay Jayasinghe, Jackie Kleynhans, Karl G. Kristinsson, Shamez Ladhani, Allison McGeer, Jason M. Mwenda, J. Pekka Nuorti, Kazunori Oishi, Leah J. Ricketson, Juan Carlos Sanz, Larisa Savrasova, Lena Setchanova, Andrew Smith, Palle Valentiner‐Branth, Marı́a Teresa Valenzuela, Mark van der Linden, Nina M. van Sorge, Emmanuelle Varon, Brita Askeland Winje, İnci Yıldırım, Jonathan Zintgraff, Maria Deloria Knoll

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of TorontoUniversity Health NetworkUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesPan American Health OrganizationEuropean Centre for Disease Prevention and ControlBill and Melinda Gates FoundationJohns Hopkins UniversityWorld Health Organization
Mots-clésSerotypeMeningitisMedicineStreptococcus pneumoniaePediatricsIncidence (geometry)Pneumococcal conjugate vaccineVirologyBiologyMicrobiologyAntibioticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pneumococcal conjugate vaccine (PCV) introduction has reduced pneumococcal meningitis incidence. The Pneumococcal Serotype Replacement and Distribution Estimation (PSERENADE) project described the serotype distribution of remaining pneumococcal meningitis in countries using PCV10/13 for least 5–7 years with primary series uptake above 70%. The distribution was estimated using a multinomial Dirichlet regression model, stratified by PCV product and age. In PCV10-using sites (N = 8; cases = 1141), PCV10 types caused 5% of cases <5 years of age and 15% among ≥5 years; the top serotypes were 19A, 6C, and 3, together causing 42% of cases <5 years and 37% ≥5 years. In PCV13-using sites (N = 32; cases = 4503), PCV13 types caused 14% in <5 and 26% in ≥5 years; 4% and 13%, respectively, were serotype 3. Among the top serotypes are five (15BC, 8, 12F, 10A, and 22F) included in higher-valency PCVs under evaluation. Other top serotypes (24F, 23B, and 23A) are not in any known investigational product. In countries with mature vaccination programs, the proportion of pneumococcal meningitis caused by vaccine-in-use serotypes is lower (≤26% across all ages) than pre-PCV (≥70% in children). Higher-valency PCVs under evaluation target over half of remaining pneumococcal meningitis cases, but questions remain regarding generalizability to the African meningitis belt where additional data are needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil0,213

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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