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Enregistrement W3151687099 · doi:10.29173/jchla29457

Challenges with organization, discoverability and access in Canadian open health data repositories

2021· article· en· W3151687099 sur OpenAlexaffvenueabout
Gail M. Thornton, Ali Shiri

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Health Libraries Association / Journal de l Association de bilbiothèques de la santé du Canada · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueResearch Data Management Practices
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiscoverabilityMetadataComputer scienceWorld Wide WebMetadata repositoryOpen dataInteroperabilityInformation retrievalData elementData science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Open health data provides healthcare professionals, biomedical researchers and the general public with access to health data which has the potential to improve healthcare delivery and policy. The challenge is to create and implement appropriate metadata, or structured data about the data, to ensure that data are easy to discover, access and re-use. The goal of this study is to identify, evaluate and compare Canadian open health data repositories for their searching, browsing and navigation functionalities, the richness of their metadata description practices, and their metadata-based filtering mechanisms. Methods: Metadata-based search and browsing was evaluated in addition to the number and nature of metadata elements. Six Canadian open health data repositories across national, provincial and institutional levels were evaluated. Data collected using verbatim text recording was evaluated using an analytical framework based on the 2019 Dataverse North Metadata Best Practices guide and 2019 Data Citation Implementation Project roadmap. Results: All repositories required filtering to access "open health data." All repositories included 'subject' facets for filtering, and 'title' and 'description' on the Results List. Use case evaluations suggest improvements including advanced search, health-specific search terms, records for all repositories, and links to related publications. Discussion: Consistent use of 'title' and 'description' suggests that an interoperable interface is possible. Inconsistencies in records indicate the need for explicit, easy to find mechanisms to access metadata in repositories. The analytical framework represents first draft guidelines for metadata creation and implementation to improve organization, discoverability, and access to Canadian open health data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,153
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,305
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Communication savante, Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Qualitatif · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,989
Score d'incertitude au seuil0,939

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1530,305
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0330,058
Études des sciences et des technologies0,0310,021
Communication savante0,0510,022
Science ouverte0,0110,022
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeQualitatif
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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