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Enregistrement W3151853001 · doi:10.1111/bju.15418

Longitudinal follow‐up and performance validation of an mRNA‐based urine test (Xpert <sup>®</sup> Bladder Cancer Monitor ) for surveillance in patients with non‐muscle‐invasive bladder cancer

2021· article· en· W3151853001 sur OpenAlexaff
Barrett E. Cowan, Eric Klein, Ken Jansz, K.R. Westenfelder, Timothy Bradford, Chad S. Peterson, Douglas S. Scherr, Lawrence I. Karsh, Blair Egerdie, Alfred Witjes, Andrew Trainer, Richard Harris, Bernard Goldfarb, Stanley Flax, Robert Kroeger, Buffi Boyd, Joseph C. Liao, Sanjay Patel, Julia A. Bridge, Victor E. Reuter, Neil B. Quigley, Sarah Brown, Suling Zhao, Malini Satya, Michael Bates, Iris Simón, S. Campbell, Yair Lotan

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Urology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBladder and Urothelial Cancer Treatments
Établissements canadiensNorth York General HospitalInnovation Initiatives Ontario NorthBaylis Medical (Canada)Professional Engineers Ontario
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésMedicineCystoscopyBladder cancerUrine cytologyCytologyUrineUrologyCancerInternal medicineHazard ratioGastroenterologyUrinary systemPathologyConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To evaluate the performance of the Xpert Bladder Cancer Monitor (Xpert; Cepheid, Sunnyvale, CA, USA) test as a predictor of tumour recurrence in patients with non-muscle-invasive bladder cancer (NMIBC). PATIENTS AND METHODS: Patients (n = 429) undergoing surveillance for NMIBC underwent Xpert, cytology, and UroVysion testing. Patients with a positive Xpert and a negative cystoscopy result (positive-negative [PN] group, n = 66) and a control group of double negative patients (negative Xpert and cystoscopy results [NN] group) were followed for 12 months (±90 days). RESULTS: Histology-confirmed recurrences were detected in 58 patients (13.5%). Xpert had an overall sensitivity of 60.3% and a specificity of 76.5%. The sensitivity for high-grade (HG) cancer was 87% with a negative predictive value (NPV) of 99%. Urine cytology showed an overall sensitivity of 23.2% (47.6% sensitivity for HG tumours) and a specificity of 88.3%. In the PN group, 32% (n = 21) developed a recurrence within 12 months, 11 of which were HG tumours. In the NN control group, 14% (n = 9) developed a recurrence and only two were HG tumours. The hazard ratio for developing recurrence in the PN group was 2.68 for all tumours and 6.84 for HG cancer. CONCLUSIONS: The Xpert test has a high sensitivity for detecting the recurrence of cancer and a high NPV for excluding HG cancer. In addition, the data suggest that patients with a positive Xpert assay in the setting of negative cystoscopy are at high risk for recurrence and need close surveillance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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