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Enregistrement W3152207758 · doi:10.1136/jmedgenet-2020-107595

Phenotypic spectrum and genomics of undiagnosed arthrogryposis multiplex congenita

2021· article· en· W3152207758 sur OpenAlex
Annie Laquerrière, Dana Jaber, Emanuela Abiusi, Jérôme Maluenda, Dan Mejlachowicz, Alexandre Vivanti, Radka Stoeva, Loïc Quevarec, Flora Nolent, Valérie Biancalana, Philippe Latour, Damien Sternberg, Yline Capri, Alain Verloès, Bettina Bessières, Laurence Lœuillet, Tania Attié‐Bitach, Jéléna Martinovic, Sophie Blesson, Florence Petit, Claire Bénéteau, Sandra Whalen, Florent Marguet, Jérôme Bouligand, Delphine Héron, Géraldine Viot, Jeanne Amiel, Daniel Amram, Céline Bellesme, Martine Bucourt, Laurence Faivre, Pierre‐Simon Jouk, Suonavy Khung, Sabine Sigaudy, Anne‐Lise Delezoide, Alice Goldenberg, Marie‐Line Jacquemont, Laëtitia Lambert, Valérie Layet, Stanislas Lyonnet, Arnold Münnich, Lionel Van Maldergem, Juliette Piard, Fabien Guimiot, P. Landrieu, Pascaline Létard, Fanny Pelluard, Laurence Perrin, Marie‐Hélène Saint‐Frison, Haluk Topaloğlu, Laetitia Trestard, Catherine Vincent‐Delorme, Helge Amthor, Christine Barnérias, Alexandra Benachi, Éric Bieth, Élise Boucher, Valérie Cormier‐Daire, Andrée Delahaye‐Duriez, Isabelle Desguerre, B. Eymard, Christine Francannet, Sarah Grotto, Didier Lacombe, Fanny Laffargue, Marine Legendre, Dominique Martin‐Coignard, André Mégarbané, Sandra Mercier, Mathilde Nizon, Luc Rigonnot, Fabienne Prieur, Chloé Quēlin, Hanitra Ranjatoelina-Randrianaivo, Nicoletta Resta, Annick Toutain, Hélène Verhelst, Marie Vincent, Estelle Colin, Catherine Fallet‐Bianco, Michèle Granier, R Grigorescu, Julien Saada, Marie Gonzalès, Anne Guiochon‐Mantel, Jean‐Louis Bessereau, Marcel Tawk, Marta Gut, Cyril Gitiaux, Judith Melki

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesCentre Hospitalier Universitaire de NiceInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgence de la BiomédecineAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésArthrogryposis multiplex congenitaExome sequencingGeneticsSanger sequencingBiologyArthrogryposisGenetic heterogeneityExomeGenePhenotypeCandidate geneDisease gene identificationBioinformaticsDNA sequencing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Arthrogryposis multiplex congenita (AMC) is characterised by congenital joint contractures in two or more body areas. AMC exhibits wide phenotypic and genetic heterogeneity. Our goals were to improve the genetic diagnosis rates of AMC, to evaluate the added value of whole exome sequencing (WES) compared with targeted exome sequencing (TES) and to identify new genes in 315 unrelated undiagnosed AMC families. METHODS: Several genomic approaches were used including genetic mapping of disease loci in multiplex or consanguineous families, TES then WES. Sanger sequencing was performed to identify or validate variants. RESULTS: expanding the phenotypes associated with these genes. The most frequent cause of AMC was a primary involvement of skeletal muscle (40%) followed by brain (22%). The most frequent mode of inheritance is autosomal recessive (66.3% of patients). In sporadic patients born to non-consanguineous parents (n=60), de novo dominant autosomal or X linked variants were observed in 30 of them (50%). CONCLUSION: New genes recently identified in AMC represent 21% of causing genes in our cohort. A high proportion of de novo variants were observed indicating that this mechanism plays a prominent part in this developmental disease. Our data showed the added value of WES when compared with TES due to the larger clinical spectrum of some disease genes than initially described and the identification of novel genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,551
Score d'incertitude au seuil0,576

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle