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Enregistrement W3152250314 · doi:10.1136/gutjnl-2021-324593

Enhanced donor screening for faecal microbial transplantation during COVID-19

2021· letter· en· W3152250314 sur OpenAlexafffund
Seema Nair Parvathy, John Lenehan, Ricardo Fernandes, Susan M. Poutanen, Susy Hota, Saman Maleki Vareki, Michael E. Silverman

Notice bibliographique

RevueGut · 2021
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 Clinical Research Studies
Établissements canadiensSt Joseph's Health CareUniversity of TorontoUniversity Health NetworkLawson Health Research InstituteSinai Health SystemWestern University
Organismes subventionnairesLotte and John Hecht Memorial Foundation
Mots-clésInfectivityViral loadTransmission (telecommunications)MedicineSputumCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)VirologyInternal medicineIntensive care medicineVirusDiseaseInfectious disease (medical specialty)PathologyTuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

high-risk procedure 5 due to aerosolisation and contact with infected bodily fluids (sputum, faecal matter and even bile 6 ), but linking transmission of SARS-CoV-2 to a previous endoscopic procedure is difficult, considering the large variation in both the incubation and viraemic periods.The authors did not account for the timing of endoscopy in relation to the moment of infection and/or admission.As shown by recent studies, viral load in patients with COVID-19 decreases substantially over a short period of time, 7 so even patients in critical condition might, in fact, have low viral loads when admitted to the endoscopy ward.Moreover, there is evidence that supports a rapid decline in infectivity after several days, 8 independent of viral load, 9 possibly justifying the lack of infectious isolates from the collected samples.In our own experience, there have been significant delays in access to endoscopy for patients with COVID-19 (data currently under review for publication), and this might, at least in part, account for the results of Boškoski et al.The findings of the study are reassuring, and we would like to point out that, even positive PCR findings would still not be enough to confirm infectivity since viral viability should be demonstrated by means of culture rather than PCR.Due to the significant impact of the SARS-CoV-2 on patient care, in-depth studies to establish clear correlations between viral load, infectivity and transmission risks are required to provide definitive answers in this matter.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0090,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,424
Écart entre enseignants0,335 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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