Characterization of Proteins Involved in MYB Transcription Factor Complexes that Regulate Suberin Deposition in Arabidopsis thaliana
Notice bibliographique
Résumé
Terrestrial plants deposit cell wall-associated, glycerolipid-based polymeric barriers in specific tissue layers as protection against various environmental stresses (e.g.drought, salinity, toxins, and pathogens).One of these barriers, suberin, is found in the cell walls of various underground and aerial tissues, including root endodermis, tuber periderms, and bark (cork).Suberin influences water uptake and retention, ion transport, and gas exchange within roots.A set of myeloblastosis (MYB)-type transcription factors (TFs) has been found to regulate suberin production in the model plant Arabidopsis thaliana.The functions of MYB TFs are known to be influenced by protein-protein interactions with other TFs at the promoters of target genes.Hence, the main focus of this study was to characterize protein-protein interactions involving MYB TFs that regulate suberin deposition in root endodermis.I used a targeted yeast two-hybrid assay to identify a physical interaction between Arabidopsis MYB92 and MYB93 with bHLH111 (a basic helix-loop-helix TF).In addition, the root expression pattern of the bHLH111 gene, as visualized by a promoter : reporter gene (GUS) assay, was consistent with a role in regulating suberin deposition in the endodermis.Knock-out mutations of bHLH111 and the related bHLH112 gene were found to have reduced levels of suberin in young Arabidopsis roots.Altogether, these findings provide evidence for bHLH proteins working together with MYB TFs to regulate suberin production in the root endodermis of Arabidopsis.me the opportunity to perform my experiments in his lab and for all of his invaluable guidance throughout my MSc project.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».