Genetic Characterization of Mutations Related to Conidiophore Stalk Length Development in Aspergillus niger Laboratory Strain N402
Notice bibliographique
Résumé
Aspergillus niger is an important filamentous fungus in industrial biotechnology for the production of citric acid and enzymes. In the late 1980s, the A. niger N400/NRRL3 strain was selected for both fundamental and applied studies in relation to several processes including gluconic acid and protein production. To facilitate handling of A. niger , the N400 wild-type strain was UV mutagenized in two consecutive rounds to generate N401 and N402. N402 was used as a reference laboratory strain and exhibits the phenotypes with reduced conidiophore stalk length and reduced radial growth. The conidiophore stalk length and radial growth of A. niger strain N400 were determined and compared to N401 and N402. The length of N400 conidiophore stalks (2.52 ± 0.40 mm) was reduced in N401 and N402 to 0.66 ± 0.14 mm and 0.34 ± 0.06 mm, respectively. Whereas N400 reached a colony diameter of 6.7 ± 0.2 cm after 7 days, N401 and N402 displayed reduced radial growth phenotype (4.3 ± 0.1 and 4.1 ± 0.1, respectively). To identify the mutations (dubbed cspA and cspB ) responsible for the phenotypes of N401 and N402, the genomes were sequenced and compared to the N400 genome sequence. A parasexual cross was performed between N400 and N402 derivatives to isolate segregants which allowed cosegregation analysis of single nucleotide polymorphisms and insertions and deletions among the segregants. The shorter conidiophore stalk and reduced radial growth in N401 ( cspA ) was found to be caused by a 9-kb deletion on chromosome III and was further narrowed down to a truncation of NRRL3_03857 which encodes a kinesin-like protein homologous to the A. nidulans UncA protein. The mutation responsible for the further shortening of conidiophore stalks in N402 ( cspB ) was found to be caused by a missense mutation on chromosome V in a hitherto unstudied C2H2 transcription factor encoded by the gene NRRL3_06646. The importance of these two genes in relation to conidiophore stalk length and radial growth was confirmed by single and double gene deletion studies. The mutations in the laboratory strain N402 should be taken into consideration when studying phenotypes in the N402 background.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».