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Enregistrement W3152761842 · doi:10.1021/acs.cgd.1c00082

Mechanisms of Interaction of Biomolecule Phosphate Side Chains with Calcite during Dissolution

2021· article· en· W3152761842 sur OpenAlexafffund
Valentin Nelea, Jeanne Paquette, Marc D. McKee

Notice bibliographique

RevueCrystal Growth & Design · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueCalcium Carbonate Crystallization and Inhibition
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésCalciteDissolutionChemistryPyrophosphateBiophysicsCalcium carbonatePhosphateCalciumBiomineralizationAmorphous calcium carbonateBiomoleculePhosphoproteinCrystallographySerineCleavage (geology)PhosphoserineAmino acidBiochemistryPhosphorylationMineralogyChemical engineeringOrganic chemistryMaterials scienceEnzymeBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In proteins, phosphorylation of amino acid residues confers unique functions, including mineral-binding properties. For example, osteopontin, an abundant phosphoprotein in many biomineralized tissues and structures including bones, teeth, otoconia, and shells, can be variably and extensively phosphorylated. This post-translational modification of osteopontin imparts potent mineralization-regulating functional properties for both calcium phosphate- and calcium carbonate-containing tissues/structures. The local environment in which crystal formation (and dissolution) occurs is also rich in other nonprotein phosphate complexes such as pyrophosphate, polyphosphate (PP), and adenosine triphosphate. Here, we investigated the interaction of various small phospho-molecules with calcite under dissolution conditions. Using atomic force microscopy (AFM), we report on nanotopographic surface alterations resulting from dissolution of the (1 0 4) cleavage surface of calcite exposed to (i) a short-chain PP containing five phosphates (PP5), (ii) the phospho-amino acids P-serine, P-threonine, and P-tyrosine, and (iii) phosphorylethanolamine. We compared CORINA software-measured distances with Ca–Ca spacings characteristic of the step edges visualized experimentally by AFM to provide best-spacing matches on the (1 0 4) calcite acute and obtuse surface step directions during dissolution—this allowed for determination of plausible chiral or achiral molecular footprints for the phospho-molecules docked to Ca atoms at the dissolving calcite surface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,510
Score d'incertitude au seuil0,558

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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