Genetic variation in <i>LUMAN</i>/<i>CREB3</i> and association with stress and meat quality traits in Yorkshire pigs
Notice bibliographique
Résumé
LUMAN/CREB3 is a stress regulatory gene that affects the activity of the hypothalamic–pituitary–adrenal axis in mice and presents a promising avenue for exploring variable stress-responsiveness in pigs. Pigs with similar characteristics to LUMAN-deficient mice, including greater resilience to stress and receptivity to human handling, would be valuable in the pork industry from animal welfare and production efficiency perspectives. We previously identified eight genetic variations and five haplotypes throughout the LUMAN locus in Yorkshire pigs. In this study, we analysed associations between LUMAN variations with behavioural stress response during three tests (open field test, novel object test, and human approach test), physiological stress responsiveness (cortisol), and carcass/meat quality measurements from purebred Yorkshire pigs. Haplotypes A1 and A2 were associated with decreased activity levels in novel environments and greater plasma cortisol concentrations at slaughter. Haplotype A1 was associated with lower carcass scratch scores and meat with lower cooking losses and greater tenderness. Haplotypes B1 and B2 were associated with the opposite traits including increased activity levels in novel environments and characteristics for lower meat quality including greater cooking losses, lower marbling, and paler coloured meat. We conclude that DNA variations in the LUMAN locus could potentially be used as genetic markers for stress resistance and meat quality in pig breeding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».