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Enregistrement W3152993017 · doi:10.3390/biom11040578

The Emerging Role of Epigenetic Mechanisms in the Causation of Aberrant MMP Activity during Human Pathologies and the Use of Medicinal Drugs

2021· review· en· W3152993017 sur OpenAlexafffund
Hassan Sarker, Ayman Haimour, Ravneet Toor, Carlos Fernández-Patrón

Notice bibliographique

RevueBiomolecules · 2021
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta InnovatesFondation pour la Recherche MédicaleUniversity of Alberta
Mots-clésEpigeneticsMatrix metalloproteinaseBiologyDoxycyclineMediatorMedicineBioinformaticsCancer researchImmunologyGeneCell biologyAntibioticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Matrix metalloproteinases (MMPs) cleave extracellular matrix proteins, growth factors, cytokines, and receptors to influence organ development, architecture, function, and the systemic and cell-specific responses to diseases and pharmacological drugs. Conversely, many diseases (such as atherosclerosis, arthritis, bacterial infections (tuberculosis), viral infections (COVID-19), and cancer), cholesterol-lowering drugs (such as statins), and tetracycline-class antibiotics (such as doxycycline) alter MMP activity through transcriptional, translational, and post-translational mechanisms. In this review, we summarize evidence that the aforementioned diseases and drugs exert significant epigenetic pressure on genes encoding MMPs, tissue inhibitors of MMPs, and factors that transcriptionally regulate the expression of MMPs. Our understanding of human pathologies associated with alterations in the proteolytic activity of MMPs must consider that these pathologies and their medicinal treatments may impose epigenetic pressure on the expression of MMP genes. Whether the epigenetic mechanisms affecting the activity of MMPs can be therapeutically targeted warrants further research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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