MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3153066160 · doi:10.1038/s41598-021-88157-z

C subunit of the ATP synthase is an amyloidogenic calcium dependent channel-forming peptide with possible implications in mitochondrial permeability transition

2021· article· en· W3153066160 sur OpenAlexafffund
Giuseppe Amodeo, Brenda Yasie Lee, Natalya Krilyuk, Carina T. Filice, Denis Valyuk, Daniel E. Otzen, Sergey Noskov, Zoya Leonenko, Evgeny V. Pavlov

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueATP Synthase and ATPases Research
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthLundbeckfondenH. Lundbeck A/SCanada Foundation for InnovationNational Institute of General Medical SciencesAmerican Heart Association
Mots-clésProtein subunitLipid bilayerATP synthaseCytoplasmChemistryBiophysicsMitochondrionBiochemistryInner mitochondrial membraneCell biologyPeptideGi alpha subunitBiologyMembraneGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The c subunit is an inner mitochondrial membrane (IMM) protein encoded by three nuclear genes. Best known as an integral part of the F 0 complex of the ATP synthase, the c subunit is also present in other cytoplasmic compartments in ceroid lipofuscinoses. Under physiological conditions, this 75 residue-long peptide folds into an α-helical hairpin and forms oligomers spanning the lipid bilayer. In addition to its physiological role, the c subunit has been proposed as a key participant in stress-induced IMM permeabilization by the mechanism of calcium-induced permeability transition. However, the molecular mechanism of the c subunit participation in IMM permeabilization is not completely understood. Here we used fluorescence spectroscopy, atomic force microscopy and black lipid membrane methods to gain insights into the structural and functional properties of unmodified c subunit protein that might make it relevant to mitochondrial toxicity. We discovered that c subunit is an amyloidogenic peptide that can spontaneously fold into β-sheets and self-assemble into fibrils and oligomers in a Ca 2+ -dependent manner. C subunit oligomers exhibited ion channel activity in lipid membranes. We propose that the toxic effects of c subunit might be linked to its amyloidogenic properties and are driven by mechanisms similar to those of neurodegenerative polypeptides such as Aβ and α-synuclein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,350

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific ReportsMême sujetATP Synthase and ATPases ResearchTravaux en français237 207