MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3153079368 · doi:10.1183/13993003.02975-2020

Association between the renin–angiotensin system and chronic lung allograft dysfunction

2021· article· en· W3153079368 sur OpenAlexafffund
Grégory Berra, Sofia Farkona, Zahraa Mohammed‐Ali, Max Kotlyar, Liran Levy, Sergi Clotet‐Freixas, Phillip Ly, Benjamin Renaud‐Picard, Tina Daigneault, Allen Duong, Ihor Batruch, Igor Jurišica, Ana Konvalinka, Tereza Martinu

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTransplantation: Methods and Outcomes
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteToronto General HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanada Foundation for InnovationKidney Foundation of CanadaToronto General and Western Hospital FoundationCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Donation and Transplantation Research Program
Mots-clésAngiotensin IIBronchoalveolar lavageMedicineLungRenin–angiotensin systemImmunostainingPathologyInternal medicineEndocrinologyReceptorImmunohistochemistryBlood pressure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic lung allograft dysfunction (CLAD) is the major cause of death after lung transplantation. Angiotensin II (AngII), the main effector of the renin–angiotensin system, elicits fibrosis in both kidney and lung. We identified six AngII-regulated proteins (Ras homolog family member B (RHOB), bone marrow stromal cell antigen 1 (BST1), lysophospholipase 1 (LYPA1), glutamine synthetase (GLNA), thrombospondin 1 (TSP1) and laminin subunit β2 (LAMB2)) that were increased in urine of patients with kidney allograft fibrosis. We hypothesised that the renin–angiotensin system is active in CLAD and that AngII-regulated proteins are increased in bronchoalveolar lavage fluid (BAL) of CLAD patients. We performed immunostaining of AngII receptors (AGTR1 and AGTR2), TSP1 and GLNA in 10 CLAD lungs and five controls. Using mass spectrometry, we quantified peptides corresponding to AngII-regulated proteins in BAL of 40 lung transplant recipients (stable, acute lung allograft dysfunction (ALAD) and CLAD). Machine learning algorithms were developed to predict CLAD based on BAL peptide concentrations. Immunostaining demonstrated significantly more AGTR1 + cells in CLAD versus control lungs (p=0.02). TSP1 and GLNA immunostaining positively correlated with the degree of lung fibrosis (R 2 =0.42 and 0.57, respectively). In BAL, we noted a trend towards higher concentrations of AngII-regulated peptides in patients with CLAD at the time of bronchoscopy, and significantly higher concentrations of BST1, GLNA and RHOB peptides in patients that developed CLAD at follow-up (p<0.05). The support vector machine classifier discriminated CLAD from stable and ALAD patients at the time of bronchoscopy (area under the curve (AUC) 0.86) and accurately predicted subsequent CLAD development (AUC 0.97). Proteins involved in the renin–angiotensin system are increased in CLAD lungs and BAL. AngII-regulated peptides measured in BAL may accurately identify patients with CLAD and predict subsequent CLAD development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil0,318

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEuropean Respiratory JournalMême sujetTransplantation: Methods and OutcomesTravaux en français237 207