Does miRNA Expression in the Spent Media Change During Early Embryo Development?
Notice bibliographique
Résumé
Distinct miRNA populations have been detected in the spent media of in-vitro culture systems. However, profiling has been limited to media conditioned with blastocyst-stage embryos. Therefore, the aim of the study was to profile extracellular miRNAs throughout the pre-implantation period in bovine embryos. To achieve this, cumulus oocyte complexes were aspirated from ovaries, in-vitro matured, fertilized, and cultured under standard laboratory procedures to the 2-cell, 8-cell, or blastocyst stage of development. At each developmental stage, 25 μl of spent in-vitro culture media was collected, pooled to 300 μl, and processed for total RNA extraction. In-vitro culture media, which never came in contact with any embryos, were additionally processed for total RNA extraction to serve as a negative control. Following hybridization on a GeneChip miRNA 4.0 array, comparative analysis was conducted between spent media and control samples. In total, 111 miRNAs were detected in the spent media samples, with 56 miRNAs identified in blastocyst spent media, 14 miRNAs shared between 8-cell and blastocyst spent media, 7 miRNAs shared between all 3 conditions, and 6 miRNAs exclusive to 2-cell spent media. miRNA-mRNA target prediction analysis revealed that the majority of genes predicted to be regulated by the miRNAs identified in the study have roles in cellular process, metabolic process, and biological regulation. Overall, the study suggest that miRNAs can be detected in the spent media of in-vitro culture system throughout the pre-implantation period and the detected miRNAs may influence genes impacting early embryo development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».