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Enregistrement W3153212773 · doi:10.1016/j.pecon.2021.03.001

Combining DNA and people power for healthy rivers: Implementing the STREAM community-based approach for global freshwater monitoring

2021· article· en· W3153212773 sur OpenAlexafffundabout
Chloe V. Robinson, Donald J. Baird, Michael Wright, Teresita M. Porter, Kat Hartwig, E. Hendriks, Laura Maclean, R. Mallinson, Wendy A. Monk, Catherine Paquette, Mehrdad Hajibabaei

Notice bibliographique

RevuePerspectives in Ecology and Conservation · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensWorld Wildlife Fund CanadaEnvironment and Climate Change CanadaUniversity of New BrunswickUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesEnvironment and Climate Change CanadaGovernment of CanadaOntario Genomics InstituteGenome Canada
Mots-clésStewardship (theology)BiodiversityEnvironmental resource managementEnvironmental DNAEnvironmental monitoringOutreachWatershedCitizen scienceFreshwater ecosystemScale (ratio)EcosystemEnvironmental scienceGeographyEcologyComputer scienceBiologyCartographyEnvironmental engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is an urgent need for rapid, standardised, accurate and accessible monitoring techniques to better detect and quantify change given the increasing threat of degradation and biodiversity loss in freshwater ecosystems. Community-based monitoring projects have been proven successful for the collection of meaningful biological data from a range of target species and ecosystems. The STREAM (Sequencing the Rivers for Environmental Assessment and Monitoring) project combines community-based monitoring with a DNA metabarcoding approach to assess aquatic ecosystem health by determining biodiversity of benthic macroinvertebrate species across Canadian watersheds. STREAM consists of outreach and recruitment, training and dissemination of results obtained from sequence data, allowing rapid generation of watershed biodiversity reports (e.g. in 2 months). We emphasise the benefits of partnering with community groups in these DNA biomonitoring efforts, highlighting the value of environmental stewardship and eliminating bottlenecks for scientific data collection. We believe the approach taken in STREAM is not only applicable to Canada, but functions as an ideal model for freshwater monitoring on a global scale.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,673

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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