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Enregistrement W3153625758 · doi:10.20944/preprints202104.0458.v1

Phylogenetic Analyses of New Aquatic Hyphomycetes Provide Molecular Evidence for <em>Microthyriaceae</em> (<em>Dothideomycetes, Ascomycota</em>) Anamorph

2021· preprint· en· W3153625758 sur OpenAlexaff
Min Qiao, Hua Zheng, Jishu Guo, Rafael F. Castañeda-Ruíz, Jianping Xu, Jie Peng, Ke‐Qin Zhang, Ze‐Fen Yu

Notice bibliographique

RevuePreprints.org · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHyphomycetesDothideomycetesBiologyParaphylyMonophylyAscomycotaPhylogenetic treeTaxonomy (biology)BotanyZoologyGenusEvolutionary biologyGeneCladeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fungal family Microthyriaceae is represented by relatively few mycelial cultures and DNA sequences. As a result, the taxonomy and classification of this group of organisms remain poorly understood. Here, based on DNA sequences at four gene fragments (nuLSU rDNA, nuSSU rDNA, TEF1 and RPB2) in our analyses of aquatic hyphomycetes from southern China, we identify and report four new genera (Antidactylaria, Isthmomyces, Keqinzhangia, Pseudocoronospora) and thirteen new species (Antidactylaria minifimbriata, Pseudocoronospora hainanensis, Isthmomyces oxysporus, I. dissimilis, I. macrosporus, I. relanceatus, Keqinzhangia aquatica, Triscelophorus anakonajensis, T. anisopterioides, T. guizhouensis, T. mugecuoensis, T. multibrachiatus, T. neoseptatus; new combinations Isthmomyces asymmetrica, I. basitruncata, I. geniculata, I. lanceata, I. minima, I. rotundata) belonging to Microthyriaceae. Our results provided the first molecular evidence of asexual morph of this family and strengthened the phylogenetic placement of the family in class Dothideomycetes. The addition of these new taxa made Microthyriaceae the largest family comprising freshwater asexual genera in Pleosporomycetidae. In addition, we confirmed the monophyly of the genus Triscelophorus, the paraphyly of the genus Isthmolongispora, and revised 6 new combinations in Isthmolongispora. ITS barcoding of 13 species were also provided to help identify aquatic hyphomycetes in the future. Our results suggest that the asexual genera and sexual genera identified so far within this family have completely different ecological niches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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