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Enregistrement W3153669209 · doi:10.3390/cancers13081894

The Screen Project: Guided Direct-To-Consumer Genetic Testing for Breast Cancer Susceptibility in Canada

2021· article· en· W3153669209 sur OpenAlexafffundabout
Steven A. Narod, Nicole Gojska, Ping Sun, Angelina Tryon, Joanne Kotsopoulos, Kelly Metcalfe, Mohammad R. Akbari

Notice bibliographique

RevueCancers · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensPublic Health OntarioWomen's College HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesWomen's College Hospital
Mots-clésMedicineGenetic testingGenetic counselingBreast cancerOvarian cancerFamily medicineGynecologyTest (biology)Internal medicineCancerOncologyGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is limited information of the outcomes of direct-to-consumer testing for BRCA1 and BRCA2 mutations. The Screen Project was initiated in 2017 to offer BRCA1 and BRCA2 genetic screening to all Canadians over the age of 18 who wish to know their mutation status. Patients enrolled in the study from 2017 to 2019 and were followed for one year after the receipt of a genetic test result. Study subjects registered online and were sent a saliva sample kit, which was shipped to the reference laboratory. Pre-test genetic counselling and counselling for mutation-negative subjects was optional and at the individual's discretion. There were 1269 tested individuals between March 2017 and January 2019. A total of 1157 (93%) were women and 87 (7%) were men. Sixty-six percent had a first- or second-degree relative with breast or ovarian cancer. Of the 1269 tested individuals, 30 (2.4%) had a pathogenic mutation in BRCA1 or BRCA2 (20 women and 10 men). Seventy-five percent of the female mutation carriers underwent a bilateral mastectomy and/or salpingo-oophorectomy within a year of receiving a positive result. Genetic counselling was available at no cost to all participants but was requested by only 5% of the non-carriers. The study subjects expressed a high degree of satisfaction with the process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,373

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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