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Enregistrement W3153812813 · doi:10.1007/s13595-021-01051-6

A genomic dataset of single‐nucleotide polymorphisms generated by ddRAD tag sequencing in Q. petraea (Matt.) Liebl. populations from Central-Eastern Europe and Balkan Peninsula

2021· article· en· W3153812813 sur OpenAlexfundno aff
Endre Gy. Tóth, Zoltán A. Köbölkuti, Klára Cseke, József D. Kámpel, Roland Takács, Vladimir T. Tomov, Péter Ábrán, Srđan Stojnić, Erna Vaštag, Mилaн Maтaругa, Vanja Daničić, Egzon Tahirukaj, P. Zhelev, Saša Orlović, Attila Benke, Attila Borovics

Notice bibliographique

RevueAnnals of Forest Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistarstvo Prosvete, Nauke i Tehnološkog RazvojaBulgarian National Science FundManitoba Agriculture, Food and Rural Development
Mots-clésBiologySingle-nucleotide polymorphismMetadataPopulationSNPEvolutionary biologyBalkan peninsulaGeneticsQuercus petraeaGeographyGenotypeBotanyGeneDemographyComputer scienceEcologyWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Key message This genomic dataset provides highly variable SNP markers from georeferenced natural Quercus petraea (Matt.) Liebl. populations collected in Bulgaria, Hungary, Romania, Serbia, Bosnia and Herzegovina, Kosovo* and Albania. These SNP loci can be used to assess genetic diversity, differentiation, and population structure, and can also be used to detect signatures of selection and local adaptation. The dataset can be accessed at https://doi.org/10.5281/zenodo.3908963/ (Tóth et al. 2020 ). Associated metadata available at https://metadata-afs.nancy.inra.fr/geonetwork/srv/fre/catalog.search#/metadata/b6fee4fa-01e9-44d0-92f5-ad19379f9693 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,310
Score d'incertitude au seuil0,444

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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