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Enregistrement W3153924084 · doi:10.18632/genesandcancer.210

Key drug-targeting genes in pancreatic ductal adenocarcinoma

2021· article· en· W3153924084 sur OpenAlexafffund
Meena Kishore Sakharkar, Sarinder Kaur Dhillon, Mohit Mazumder, Jian Yang

Notice bibliographique

RevueGenes & Cancer · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesCollege of Pharmacy and Nutrition, University of Saskatchewan
Mots-clésBleomycinMedicineIn vivoCancer researchSerpinPancreatic cancerCancerDownregulation and upregulationAdenocarcinomaPharmacologyChemotherapyBioinformaticsBiologyGeneInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a highly lethal type of cancer.In this study, we undertook a pairwise comparison of gene expression pattern between tumor tissue and its matching adjacent normal tissue for 45 PDAC patients and identified 22 upregulated and 32 downregulated genes.PPI network revealed that fibronectin 1 and serpin peptidase inhibitor B5 were the most interconnected upregulated-nodes.Virtual screening identified bleomycin exhibited reasonably strong binding to both proteins.Effect of bleomycin on cell viability was examined against two PDAC cell lines, AsPC-1 and MIA PaCa-2.AsPC-1 did not respond to bleomycin, however, MIA PaCa-2 responded to bleomycin with an IC 50 of 2.6 μM.This implicates that bleomycin could be repurposed for the treatment of PDAC, especially in combination with other chemotherapy agents.In vivo mouse xenograft studies and patient clinical trials are warranted to understand the functional mechanism of bleomycin towards PDAC and optimize its therapeutic efficacy.Furthermore, we will evaluate the antitumor activity of the other identified drugs in our future studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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