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Enregistrement W3154092642 · doi:10.1186/s12874-021-01258-1

Guidelines are needed for studies of pre-treatment HIV drug resistance: a methodological study

2021· review· en· W3154092642 sur OpenAlexaff
Lawrence Mbuagbaw, Clémence Ongolo-Zogo, Olivia Mendoza, Babalwa Zani, Frederick Morfaw, Agatha Nyambi, Annie Wang, Michel Kiflen, Hussein El-Kechen, Alvin Leenus, Mark Youssef, Nadia Rehman, Lucas E. Hermans, Virginia Macdonald, Silvia Bertagnolio

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Research Methodology · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS Research and Interventions
Établissements canadiensUniversity of OttawaPopulation Health Research InstituteMcMaster UniversityOntario HIV Treatment NetworkHamilton Health SciencesSt. Joseph’s Healthcare HamiltonImpact
Organismes subventionnairesWorld Health Organization
Mots-clésGeneralizability theoryMedicineQuartileFamily medicineTransgenderMEDLINEDemographyPsychologyInternal medicineConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The expansion of access to antiretroviral therapy (ART) has been accompanied by an increase in pre-treatment drug resistance (PDR). While it is critical to monitor the increasing prevalence of PDR across countries and populations to inform optimal regimen selection, the completeness of reporting is often suboptimal, limiting the interpretation and generalizability of the results. Indeed, there is no formal guidance on how studies investigating the prevalence of drug resistance should be reported. Thus, we sought to determine the completeness of reporting in studies of PDR and the factors associated with sub-optimal reporting to ascertain the need for guidelines. METHODS: As part of a systematic review on the global prevalence of PDR in key populations (men who have sex with men, sex workers, transgender people, people who inject drugs and people in prisons), we searched 10 electronic databases until January 2019. We extracted information on selected study characteristics useful for interpreting prevalence data. Data were extracted in duplicate. Analyses of variance and correlation were used to explore factors that may explain the number of items reported. RESULTS: We found 650 studies of which 387 were screened as full text and 234 were deemed eligible. The included studies were published between 1997 and 2019 and included a median of 239 (quartile 1 = 101; quartile 3 = 778) participants. Most studies originated from high-income countries (125/234; 53.0%). Of 23 relevant data items, including study design, setting, participant sociodemographic characteristics, HIV risk factors, type of resistance test conducted, definition of resistance, the mean (standard deviation) number of items reported was 13 (2.2). We found that more items were reported in studies published more recently (r = 0.20; p < 0.002) and in studies at low risk of bias (F [2231] = 8.142; p < 0.001). CONCLUSIONS: Incomplete reporting in studies on PDR makes characterising levels of PDR in subpopulations across countries challenging. Hence, guidelines are needed to define a minimum set of variables to be included in such studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,095
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,668
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,596
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0950,668
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0110,003
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,913
Tête enseignante GPT0,734
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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