Antifreeze protein from Ammopiptanthus nanus functions in temperature-stress through domain A
Notice bibliographique
Résumé
Temperature stress restricts plant growth and development. Antifreeze protein (AFP) can improve plants antifreeze ability. In our previous study, the AnAFP gene cloned from Ammopiptanthus nanus was confirmed to be an excellent candidate enhancing plant cold resistance. But, AnAFP protein shared similar structures with KnS type dehydrins including K, N and S domains except ice crystal binding domain A. Here, we generated AnAFPΔA, AnAFPΔK, AnAFPΔN and AnAFPΔS, and transformed them into ordinary and cold sensitive strains of E. coli, and Arabidopsis KS type dehydrin mutant to evaluate their function. Expression of AnAFPΔA decreases cold and heat tolerance in E. coli, meanwhile, AnAFP enhances heat tolerance in Arabidopsis, suggesting that domain A is a thermal stable functional domain. AnAFP, AnAFPΔA and AnAFPΔS localize in whole cell, but AnAFPΔK and AnAFPΔN only localizes in nucleus and cytoplasm, respectively, exhibiting that K and N domains control localization of AnAFP. Likewise, K domain blocks interaction between AnAFP and AnICE1. The result of RT-qPCR showed that expression of AnAFP, AnICE1 and AnCBF genes was significantly induced by high-temperature, indicating that the AnAFP is likely regulated by ICE1-CBF-COR signal pathway. Taken together, the study provides insights into understanding the mechanism of AnAFP in response to temperature stress and gene resource to improve heat or cold tolerance of plants in transgenic engineering.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».