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Enregistrement W3154244319 · doi:10.1016/j.patter.2021.100226

A review of dynamical systems approaches for the detection of chaotic attractors in cancer networks

2021· review· en· W3154244319 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePatterns · 2021
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene Regulatory Network Analysis
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesConcordia UniversityMcGill University
Mots-clésAttractorCausality (physics)Computer scienceState spaceDynamical systems theoryInferenceToolboxChaoticCausal inferenceArtificial intelligenceDECIPHERCancerSeries (stratigraphy)Machine learningBioinformaticsBiologyMathematicsEconometricsStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancers are complex dynamical systems. They remain the leading cause of disease-related pediatric mortality in North America. To overcome this burden, we must decipher the state-space attractor dynamics of gene expression patterns and protein oscillations orchestrated by cancer stemness networks. The review provides an overview of dynamical systems theory to steer cancer research in pattern science. While most of our current tools in network medicine rely on statistical correlation methods, causality inference remains primitively developed. As such, a survey of attractor reconstruction methods and machine algorithms for the detection of causal structures applicable in experimentally derived time series cancer datasets is presented. A toolbox of complex systems approaches are discussed for reconstructing the signaling state space of cancer networks, interpreting causal relationships in their time series gene expression patterns, and assisting clinical decision making in computational oncology. As a proof of concept, the applicability of some algorithms are demonstrated on pediatric brain cancer datasets and the requirement of their time series analysis is highlighted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,813
Score d'incertitude au seuil0,653

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle