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Enregistrement W3154427458 · doi:10.2196/24423

Presence of Urinary Exosomes for Liquid Biopsy of Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Protocol for a Pilot Feasibility Study

2021· article· en· W3154427458 sur OpenAlexvenueno aff
Guorong Li, Nora Mallouk, Pascale Flandrin‐Gresta, Arnauld Garcin, Claude Lambert, Sid Ali Berremila, Hocine Habchi, Nicolas Mottet

Notice bibliographique

RevueJMIR Research Protocols · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal cell carcinoma treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLiquid biopsyMedicineExosomeBiopsyMicrovesiclesClear cell renal cell carcinomaRenal cell carcinomaPathologyUrinary systemRadiologyInternal medicineCancermicroRNABiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Approximately 70%-80% of kidney cancers are clear cell renal cell carcinomas (CCRCCs). Patient management is based on imaging (abdominal ultrasound and computerized tomography), surgical excision of the tumor, and pathological analysis. A tissue biopsy is therefore necessary to confirm the diagnosis and avoid unnecessary nephrectomy. For metastatic cancers, a tissue biopsy is essential for establishing the targeted therapy. This biopsy of tumor material is invasive and painful. Other techniques such as liquid biopsy would help reduce the need for tissue biopsy. The development of a simple biological test for diagnosis is essential. CA9 is a powerful marker for the diagnosis of CCRCC. Exosomes have become a major source of liquid biopsy because they carry tumor proteins, RNA, and lipids. Urine is the most convenient biological liquid for exosome sampling. OBJECTIVE: The aim of this study (PEP-C study) is mainly to determine whether it is possible to detect urinary exosomal CA9 for the molecular diagnosis of CCRCC. METHODS: This study will include 60 patients with CCRCC and 40 noncancer patients. Exosomes will be isolated from urine samples and exosomal CA9 will be detected by transmission electron microscopy, flow cytometry, and reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction. RESULTS: This study is currently underway with funding support from the CHU Saint-Etienne of France. CONCLUSIONS: We expect to demonstrate that urinary tumor exosomes could be a novel liquid biopsy to diagnose CCRCC and to guide clinicians in treatment decision-making. TRIAL REGISTRATION: ClinicalTrials.gov NCT04053855; https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04053855. INTERNATIONAL REGISTERED REPORT IDENTIFIER (IRRID): DERR1-10.2196/24423.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,014
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,110

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0140,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0330,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,375
Tête enseignante GPT0,530
Écart entre enseignants0,156 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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