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Enregistrement W3154545871 · doi:10.1016/j.phro.2021.04.001

Automated detection of dental artifacts for large-scale radiomic analysis in radiation oncology

2021· article· en· W3154545871 sur OpenAlexafffund
Colin Arrowsmith, Reza Reiazi, Mattea Welch, Michal Kazmierski, Tirth Patel, Aria Rezaie, Tony Tadic, Scott V. Bratman, Benjamin Haibe‐Kains

Notice bibliographique

RevuePhysics and Imaging in Radiation Oncology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensVector InstituteOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of TorontoUniversity Health NetworkPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer FoundationUniversity Health Network
Mots-clésRadiation oncologyPrecision oncologyScale (ratio)Medical physicsMedicineRadiation therapyComputer scienceOncologyRadiologyInternal medicineCancerCartography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: Computed tomography (CT) is one of the most common medical imaging modalities in radiation oncology and radiomics research, the computational voxel-level analysis of medical images. Radiomics is vulnerable to the effects of dental artifacts (DA) caused by metal implants or fillings and can hamper future reproducibility on new datasets. In this study we seek to better understand the robustness of quantitative radiomic features to DAs. Furthermore, we propose a novel method of detecting DAs in order to safeguard radiomic studies and improve reproducibility. MATERIALS AND METHODS: We analyzed the correlations between radiomic features and the location of dental artifacts in a new dataset containing 3D CT scans from 3211 patients. We then combined conventional image processing techniques with a pre-trained convolutional neural network to create a three-class patient-level DA classifier and slice-level DA locator. Finally, we demonstrated its utility in reducing the correlations between the location of DAs and certain radiomic features. RESULTS: We found that when strong DAs were present, the proximity of the tumour to the mouth was highly correlated with 36 radiomic features. We predicted the correct DA magnitude yielding a Matthews correlation coefficient of 0.73 and location of DAs achieving the same level of agreement as human labellers. CONCLUSIONS: Removing radiomic features or CT slices containing DAs could reduce the unwanted correlations between the location of DAs and radiomic features. Automated DA detection can be used to improve the reproducibility of radiomic studies; an important step towards creating effective radiomic models for use in clinical radiation oncology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,721
Score d'incertitude au seuil0,549

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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