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Enregistrement W3154614720 · doi:10.1101/2021.04.07.21254969

Imputation strategies for missing baseline neurological assessment covariates after traumatic brain injury: A CENTER-TBI study

2021· preprint· en· W3154614720 sur OpenAlexafffund
Ari Ercole, Abhishek Dixit, David Nelson, Frederick A. Zeiler, Daan Nieboer, Omar Bouamra, David Menon, Andrew IR Maas, Simone A. Dijkland, Hester F. Lingsma, Lindsay Wilson, Fiona Lecky, Ewout W. Steyerberg

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTraumatic Brain Injury and Neurovascular Disturbances
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesEuropean CommissionOne MindUniversity of Manitoba
Mots-clésMissing dataImputation (statistics)CovariateLogistic regressionGlasgow Coma ScaleStatisticsTraumatic brain injuryPoolingTime pointMedicineComputer scienceArtificial intelligenceMathematicsSurgeryPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Statistical models for outcome prediction are central to traumatic brain injury research and critical to baseline risk adjustment. Glasgow coma score (GCS) and pupil reactivity are crucial co-variates in all such models but may be measured at multiple time points between the time of injury and hospital and are subject to a variable degree of unreliability and/or missingness. Imputation of missing data may be undertaken using full multiple imputation or by simple substitution of measurements from other time points. However it is unknown which strategy is best or which time points are more predictive. We evaluated the pseudo- R 2 of logistic regression models (dichotomous survival) and proportional odds models (Glasgow Outcome Score-extended) using different imputation strategies from data from the The Collaborative European NeuroTrauma Effectiveness Research in Traumatic Brain Injury (CENTER-TBI) study. Substitution strategies were easy to implement, achieved low levels of missingness ( << 10%) and could outperform multiple imputation without the need for computationally costly calculations and pooling multiple final models. Model performance was sensitive to imputation strategy although this was small in absolute terms and clinical relevance. A strategy of using the emergency department discharge assessments and working back in time when these were missing generally performed well. Full multiple imputation had the advantage of preserving time-dependence in the models: The pre-hospital assessments were found to be relatively unreliable predictors of survival or outcome. The predictive performance of later assessments was model-dependent. In conclusion, simple substitution strategies for imputing baseline GCS and pupil response can perform well and may be a simple alternative to full multiple imputation in many cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,109
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,180
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,109
Score d'incertitude au seuil0,575

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1090,180
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0010,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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