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Enregistrement W3154761390 · doi:10.5376/mpb.2021.12.0012

Association Analysis of Resistance to Soybean Mosaic Virus and Variation in Resistance Allelic Excavation

2021· article· en· W3154761390 sur OpenAlexvenueno aff
Weiwei Wang, Lai Wei, Zhiyuan Yu, Guixing Zhao, Weiwei Bi, Lijun Liu

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHeilongjiang Academy of Agricultural SciencesHarbin Science and Technology Bureau
Mots-clésSoybean mosaic virusBiologyGeneticsGeneAlleleGenetic associationPopulationResistance (ecology)Genome-wide association studyGenetic linkageAssociation mappingGenetic analysisQuantitative trait locusPlant disease resistanceGenomeGenetic variationPlant virusVirusSingle-nucleotide polymorphismGenotypePotyvirusAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soybean Mosaic Virus (SMV) is one of the most important soybean diseases in the world, and it seriously affects soybean yield and quality. In this paper, 405 SSR molecular markers were used in genome-wide scan to analysis 327 soybean varieties in the North of China. The purpose was to search the genetic loci and excellent resistance genes related to SMV1 and SMV3, and to reveal the differences between the genetic models of varieties. The results confirmed that the genetic differences among the tested varieties were large. Through the association analysis of the population genome-wide association (GWA) and linkage group association (LGA), 14 highly significant sites related to SN1 and SN3 were found. There are three sites related to SN1 (Sat-297, sat-296, sat-154) which are coincident with or adjacent to the resistance sites found by predecessors; while there are two at SN3 (Sat-154 and sat-726) which are coincident with previous studies, and sat-154 is a resistance site shared by SN1 and SN3. 7 genes related to resistance were obtained, of which Glyma13g25420 and Glycma13g25440, Glyma14g08700 and Glyma14g08710 has resistance genes on the NBS-LRR domain; Glyma14g08900, Glyma14g08910, and Glyma14g08920 have PLP2 (Patation-like Protein) resistance genes. This study provides an important reference for SMV resistance research and technical support for soybean resistance breeding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,907
Score d'incertitude au seuil0,495

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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