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Enregistrement W3154976971 · doi:10.1099/acmi.0.000224

Purposeful microbiology comment added to urine cultures with Staphylococcus aureus increases orders for follow-up blood cultures

2021· article· en· W3154976971 sur OpenAlexaffabout
Donald Brody Duncan, Yasmeen Marbaniang Vincent, Cheryl Main

Notice bibliographique

RevueAccess Microbiology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensHamilton Health SciencesHamilton Regional Laboratory Medicine ProgramMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlood cultureBacteremiaStaphylococcus aureusMedicineUrineInternal medicineSepsisBacteriuriaEmergency medicineMicrobiologyBiologyBacteriaAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction. Patients with Staphylococcus aureus bacteriuria (SABU) often have underlying invasive disease, including S. aureus bacteremia (SAB). It has been proposed that most patients with SABU should have a blood culture done to rule out SAB. A preliminary audit suggested that our local hospitals had a low rate of follow-up blood culture orders for patients with SABU. In response to this, our microbiology laboratory changed the comment appended to urine cultures with growth of S. aureus to make a more assertive link between SABU and SAB and to recommend follow-up blood cultures. Aim. We designed a retrospective quasi-experimental study to see if the change in microbiology comment wording had an effect on clinician behaviour. We hypothesized that this simple comment change to make a more assertive link between SABU and SAB would lead to an increase in follow-up blood culture orders. Methodology. We used microbiology records to identify adult patients with urine cultures positive for Staphylococcus aureus at three acute-care hospitals in Hamilton, Ontario, Canada, for 1 year pre- and post-intervention. We recorded urine and blood culture results, timing, patient demographics, and in-hospital mortality. Results. A total of 243 adult patients with urine cultures with S. aureus were identified for inclusion. The primary outcome was met, as there was a significant increase in blood culture orders between the pre-intervention and post-intervention groups (66.9 % vs 80.4 %). This difference was mainly driven by an increase for emergency department and urgent care patients (30.6 % vs 63.6 %). The inpatient group had a high baseline rate of blood culture orders that did not change significantly (80.0 % vs 84.7 %). There was no significant change in detection of SAB (23.5 % vs 32.7 %) or inpatient mortality (18.0 % vs 24.7 %). Conclusion. Our study shows that a simple, purposeful comment appended to urine cultures with S. aureus leads to a significant increase in follow-up blood culture orders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,049
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,037

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,049
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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