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Enregistrement W3155310936 · doi:10.1101/2021.04.16.440120

Isolation of the side population from adult neurogenic niches enriches for endothelial cells

2021· preprint· en· W3155310936 sur OpenAlexafffund
Alena Kalinina, Catherine Gnyra, Yingben Xue, Diane C. Lagace

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Ottawa
Mots-clésSide populationDentate gyrusPopulationNeural stem cellStem cellBiologyCell biologyAbcg2TransporterCancer stem cellHippocampusNeuroscienceBiochemistryATP-binding cassette transporterMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In stem cell research, DNA-binding dyes offer the ability to purify live stem cells using flow cytometry as they form a low-fluorescence side population due to the activity of ABC transporters. Adult neural stem cells exist within the lateral ventricle and dentate gyrus of the adult brain yet the ability of DNA-binding dyes to identify these adult stem cells as side populations remain untested. The following experiments utilize the efflux of a DNA-binding dye, Vyrbant DyeCycle Violet (DCV), to isolate bona fide side populations in the adult mouse dentate gyrus and SVZ and test their sensitivity to ABC transporter inhibitors. A distinct side population was found in both the adult lateral ventricle and dentate gyrus using DCV fluorescence and forward scatter instead of the conventional dual fluorescence approach. These side populations responded strongly to inhibition with the ABC transporter antagonists, verapamil and fumitremorgin C. The cells in the side population were identified as cerebrovascular endothelial cells characterized by their expression of CD31. These findings, therefore, suggest that the side population analysis provides an efficient method to purify endothelial cells, but not adult neural stem cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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