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Enregistrement W3155340014 · doi:10.1080/07060661.2021.1915876

Virulence structure of <i>Blumeria graminis</i> f. sp. <i>tritici</i>, the causal agent of wheat powdery mildew, in Ontario, Canada, in 2018 and 2019

2021· article· en· W3155340014 sur OpenAlexaffvenueabout
Allen Xue, SeaRa Lim, Yuanhong Chen, Gavin Humphreys, Jim G. Menzies, Christina Cowger, Hongjie Li, Mitra Serajazari

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of GuelphAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlumeria graminisPowdery mildewBiologyVirulencePopulationCultivarGeneticsGenotypeGenePlant disease resistanceAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Powdery mildew caused by Blumeria graminis f. sp. tritici (Bgt) is a major disease of wheat (Triticum aestivum) in Ontario, which can cause 20% yield loss. The development of resistant commercial wheat cultivars is the most economical means of controlling this disease, but only if the resistance genes used are incompatible with the virulence phenotypes present in the pathogen population. The virulence structure of Bgt in Ontario was examined in 2018 and 2019. Of the 42 single colony isolates collected in Ontario greenhouses and commercial fields, 40 virulence phenotypes, assigned VP1 to VP40, were identified on a set of 24 single-gene differential genotypes. Of the 24 resistance genes possessed by the differential genotypes, eight genes including Pm1a, Pm1b, Pm1c, Pm12, Pm16, Pm21, Pm37, and MlAG12 were effective against all of the Bgt isolates. Four genes including Pm3d, Pm29, Pm34, and NCAG13 were mostly effective with resistance reactions to more than 80% of the isolates. There were no significant differences in numbers of virulence genes per isolate between the two years, or between the greenhouse and field origins. The virulence frequencies of Bgt isolates for these effective and mostly effective genes were also not significantly affected by the year of collection and their origins, suggesting that the Bgt population is relatively stable. The effective genes identified in this study may be deployed singly or used for gene pyramiding in wheat breeding programs for developing powdery mildew-resistant cultivars in Ontario.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,309
Score d'incertitude au seuil0,621

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,175
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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