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Enregistrement W3155361674 · doi:10.1016/j.envadv.2021.100052

Comparative profiling of epigenetic modifications among individuals living in different high and low air pollution zones: A pilot study from India

2021· article· en· W3155361674 sur OpenAlex
Pradyumna Kumar Mishra, Neha Bunkar, Radha Dutt Singh, Rajat Kumar, P. K. Gupta, Rajnarayan Tiwari, Lalit Lodhi, Arpit Bhargava, Koel Chaudhury

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Advances · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAir Quality and Health Impacts
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMinistry of Education, IndiaIndian Council of Medical Research
Mots-clésEpigeneticsEpigenomicsBiologyDNA methylationHistoneGene expressionTranscriptomeGeneticsBioinformaticsComputational biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epigenetic modifications act as an important bridge to regulate the complex network of gene-environment interactions. As these mechanisms determine the gene-expression patterns via regulating the transcriptomic machinery, environmental stress induced epigenetic modifications may interrupt distinct cellular functions resulting into generation of diseased phenotypes. In the present study, we used a multi-city approach to compare the epigenomic signatures of individuals living in two tiers of Indian cities categorized as low-risk and high-risk air pollution zones. The high-risk group reported marked changes in the expression levels of epigenetic modifiers (DNMT1, DNMT3a, EZH2, EHMT2 and HAT), that maintains the levels of specific epigenetic marks essential for appropriate gene functioning. These results also coincided with the observed alterations in the levels of DNA methylation (LINE-1 and % 5mC), and histone modifications (H3 and H4), among the high-risk group. In addition, higher degree of changes reported in the expression profile of a selected miRNA panel in the high-risk group indicated the probability of deregulated transcriptional machinery. This was further confirmed by the analysis of a target gene panel involved in various signalling pathways, which revealed differential expression of the gene transcripts regulating cell cycle, inflammation, cell survival, apoptosis and cell adhesion. Together, our results provide first insights of epigenetic modifications among individuals living in different high and low levels of air pollution zones of India. However, further steps to develop a point-of-care epigenomic assay for human bio-monitoring may be immensely beneficial to reduce the health burden of air pollution especially in low and-middle-income countries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,650

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle