Faecal carriage of extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae in healthy volunteers and hospitalized patients in Ouagadougou, Burkina Faso: prevalence, resistance profile, and associated risk factors
Notice bibliographique
Résumé
Background: Extended spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae (ESBL-PE) are a serious challenge to patients’ treatment. The aim of this study is to determine the prevalence of ESBL-PE, investigate the associated resistance, and analyze the associated risk factors for acquisition of ESBL-PE.Methodology: A cross-sectional study was conducted on healthy volunteers and inpatients. After obtaining informed consent, rectal swabs were collected from each participant for isolation of Enterobacteriaceae on Hektoen enteric agar containing 4µg/L cefotaxime. The Enterobacteriaceae isolates were identified using biochemical tests and ESBL production was confirmed by the double-disc synergy test of amoxicillin and clavulanic acid. Antibiotic susceptibility test of each isolate was done by the disc diffusion method and interpreted using the recommendations of the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) clinical breakpoints version 5.0.Results: During the study period, prevalence of faecal ESBL-PE among the study participants was 54.5% (103/189); 53.5% among healthy volunteers and 55.7% among inpatients (p=0.87). The major ESBL-PE isolates was Escherichia coli (71%) followed by Klebsiella pneumoniae (16%). The isolates in hospitalized patients were resistant to norfloxacin (84.2%), cotrimoxazole (89.5%), and gentamicin (7.0%). The isolates from healthy volunteers were resistant to norfloxacin (86.2%), cotrimoxazole (82.8%), and gentamicin (1.7%).Gender, age, and previous antibiotic use were not significantly associated with carriage of ESBL-PE (p=0.51).Conclusion: The high prevalence of ESBL-PE in this study is worrying. There is an urgent need to develop measures to monitor and limit the spread of these multidrug-resistant organisms in healthcare facilities and the community in Burkina Faso. Keywords: faecal carriage, ESBL-PE, healthy volunteers, inpatients, Burkina Faso
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».