Development of the Czech Childhood Cancer Information System: Data Analysis and Interactive Visualization
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The knowledge of cancer burden in the population, its time trends, and the possibility of international comparison is an important starting point for cancer programs. A reliable interactive tool describing cancer epidemiology in children and adolescents has been nonexistent in the Czech Republic until recently. OBJECTIVE: The goal of this study is to develop a new web portal entitled the Czech Childhood Cancer Information System (CCCIS), which would provide information on childhood cancer epidemiology in the Czech Republic. METHODS: Data on childhood cancers have been obtained from the Czech National Cancer Registry. These data were validated using the clinical database of childhood cancer patients and subsequently combined with data from the National Register of Hospitalised Patients and with data from death certificates. These validated data were then used to determine the incidence and survival rates of childhood cancer patients aged 0 to 19 years who were diagnosed in the period 1994 to 2016 (N=9435). Data from death certificates were used to monitor long-term mortality trends. The technical solution is based on the robust PHP development Symfony framework, with the PostgreSQL system used to accommodate the data basis. RESULTS: The web portal has been available for anyone since November 2019, providing basic information for experts (ie, analyses and publications) on individual diagnostic groups of childhood cancers. It involves an interactive tool for analytical reporting, which provides information on the following basic topics in the form of graphs or tables: incidence, mortality, and overall survival. Feedback was obtained and the accuracy of outputs published on the CCCIS portal was verified using the following methods: the validation of the theoretical background and the user testing. CONCLUSIONS: We developed software capable of processing data from multiple sources, which is freely available to all users and makes it possible to carry out automated analyses even for users without mathematical background; a simple selection of a topic to be analyzed is required from the user.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,024 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,005 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,032 | 0,015 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».