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Enregistrement W3155846453 · doi:10.1101/2021.04.15.439950

North America Insect Invades the World: the Case of the Flood Mosquito, <i>Aedes vexans</i> (Diptera: Culicidae), from Mitochondrial DNA

2021· preprint· en· W3155846453 sur OpenAlexaboutno aff
José Heriberto Vargas-Espinosa, Oscar Alexander Aguirre-Obando

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversidad del Quindío
Mots-clésAedes vexansBiologyCladeHaplotypeRift Valley feverGene flowMitochondrial DNAZoologyEvolutionary biologyAedesEcologyGenePhylogenetic treeGeneticsGenetic variationVirusLarvaGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The flood mosquito, Aedes vexans (Diptera: Culicidae), native of Canada, and currently present in all continents, has a vector competence for 30 arboviruses, being responsible for transmitting diseases, like West Nile fever, Rift Valley fever, Saint Louis Encephalitis and Eastern Equine Encephalitis. Hence, knowing the structure and gene flow of A. vexans is important to develop adequate vector control strategies for this species. For this, from partial sequences of the mitochondrial COI gene available in Bold and GenBank, it was possible to determine the Haplotypic ( Hd ) and nucleotide (π) gene diversity, genetic structuring and gene flow at global, continental, and country levels. In total, 1184 sequences were recovered, distributed between America (88.60%), Europe (7.35%), Asia (3.89%), and Africa (0.17%). From these, 395 haplotypes (H) were detected without presence of pseudogenes (NUMTs), with H1 being the most frequent (24.58%) and between H12 - H395 the least frequent varying between 0.93% (H12) and 0.08% (H395). Phylogenetically, the haplotypes were grouped into six clades. Clade I grouped haplotypes from countries in America and Europe, while clades II and III presented haplotypes exclusively from Asia and Europe; clade IV grouped only one haplotype from Africa and the last ultimo clade V grouped haplotypes from America and Africa. The global Hd and π was 0.92 and 0.01, respectively. In addition, evidence was obtained of genetic structuring among continents (7.07%), countries (1.62%), and within countries (91.30%; F ST = 0.08, p < 0.05) and no isolation by distance was detected (r = 0.003, p > 0.05). These results suggest that the mosquito populations that invaded other continents originate directly from the American continent, where possibly transcontinental commercial routes favored their long-distance dispersion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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