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Enregistrement W3155972762 · doi:10.1136/bmjopen-2020-043497

Can synthetic data be a proxy for real clinical trial data? A validation study

2021· article· en· W3155972762 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueData Quality and Management
Établissements canadiensUniversity of OttawaMcGill University Health CentreChildren's Hospital of Eastern OntarioMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésUnivariateMedicineBivariate analysisMultivariate statisticsMetric (unit)Synthetic dataStatisticMultivariate analysisData miningProxy (statistics)StatisticsInternal medicineComputer scienceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: There are increasing requirements to make research data, especially clinical trial data, more broadly available for secondary analyses. However, data availability remains a challenge due to complex privacy requirements. This challenge can potentially be addressed using synthetic data. SETTING: Replication of a published stage III colon cancer trial secondary analysis using synthetic data generated by a machine learning method. PARTICIPANTS: There were 1543 patients in the control arm that were included in our analysis. PRIMARY AND SECONDARY OUTCOME MEASURES: Analyses from a study published on the real dataset were replicated on synthetic data to investigate the relationship between bowel obstruction and event-free survival. Information theoretic metrics were used to compare the univariate distributions between real and synthetic data. Percentage CI overlap was used to assess the similarity in the size of the bivariate relationships, and similarly for the multivariate Cox models derived from the two datasets. RESULTS: Analysis results were similar between the real and synthetic datasets. The univariate distributions were within 1% of difference on an information theoretic metric. All of the bivariate relationships had CI overlap on the tau statistic above 50%. The main conclusion from the published study, that lack of bowel obstruction has a strong impact on survival, was replicated directionally and the HR CI overlap between the real and synthetic data was 61% for overall survival (real data: HR 1.56, 95% CI 1.11 to 2.2; synthetic data: HR 2.03, 95% CI 1.44 to 2.87) and 86% for disease-free survival (real data: HR 1.51, 95% CI 1.18 to 1.95; synthetic data: HR 1.63, 95% CI 1.26 to 2.1). CONCLUSIONS: The high concordance between the analytical results and conclusions from synthetic and real data suggests that synthetic data can be used as a reasonable proxy for real clinical trial datasets. TRIAL REGISTRATION NUMBER: NCT00079274.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,058
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,040
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Communication savante, Science ouverte
Catégories consensuellesMétarecherche, Science ouverte
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,438
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0580,040
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0090,017
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,897
Tête enseignante GPT0,691
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle