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Enregistrement W3156027830 · doi:10.1096/fj.202100113rr

An intron variant of the GLI family zinc finger 3 (GLI3) gene differentiates resistance training‐induced muscle fiber hypertrophy in younger men

2021· article· en· W3156027830 sur OpenAlexaff
Christopher G. Vann, Robert W. Morton, C. Brooks Mobley, Ivan J. Vechetti, Brian K. Ferguson, Cody T. Haun, Shelby C. Osburn, Casey L. Sexton, Carlton D. Fox, Matthew A. Romero, Paul A. Roberson, Sara Y. Oikawa, Chris McGlory, Kaelin C. Young, John J. McCarthy, Stuart M. Phillips, Michael D. Roberts

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Physical Performance
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesOffice of Extramural Research, National Institutes of HealthNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute on AgingAuburn University
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismGenotypeSNPBiologyMuscle hypertrophyGeneticsGeneInternal medicineEndocrinologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We examined the association between genotype and resistance training‐induced changes (12 wk) in dual x‐ray energy absorptiometry (DXA)‐derived lean soft tissue mass (LSTM) as well as muscle fiber cross‐sectional area (fCSA; vastus lateralis; n = 109; age = 22 ± 2 y, BMI = 24.7 ± 3.1 kg/m 2 ). Over 315 000 genetic polymorphisms were interrogated from muscle using DNA microarrays. First, a targeted investigation was performed where single nucleotide polymorphisms (SNP) identified from a systematic literature review were related to changes in LSTM and fCSA. Next, genome‐wide association (GWA) studies were performed to reveal associations between novel SNP targets with pre‐ to post‐training change scores in mean fCSA and LSTM. Our targeted investigation revealed no genotype‐by‐time interactions for 12 common polymorphisms regarding the change in mean fCSA or change in LSTM. Our first GWA study indicated no SNP were associated with the change in LSTM. However, the second GWA study indicated two SNP exceeded the significance level with the change in mean fCSA ( P = 6.9 × 10 –7 for rs4675569, 1.7 × 10 –6 for rs10263647). While the former target is not annotated (chr2:205936846 (GRCh38.p12)), the latter target (chr7:41971865 (GRCh38.p12)) is an intron variant of the GLI Family Zinc Finger 3 (GLI3) gene. Follow‐up analyses indicated fCSA increases were greater in the T/C and C/C GLI3 genotypes than the T/T GLI3 genotype ( P < .05). Data from the Auburn cohort also revealed participants with the T/C and C/C genotypes exhibited increases in satellite cell number with training ( P < .05), whereas T/T participants did not. Additionally, those with the T/C and C/C genotypes achieved myonuclear addition in response to training ( P < .05), whereas the T/T participants did not. In summary, this is the first GWA study to examine how polymorphisms associate with the change in hypertrophy measures following resistance training. Future studies are needed to determine if the GLI3 variant differentiates hypertrophic responses to resistance training given the potential link between this gene and satellite cell physiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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