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Enregistrement W3156108146 · doi:10.21203/rs.3.rs-329341/v1

Immunoglobulin-G Enzyme-Linked Immunosorbent Assay Predicts Neutralising Antibody Response in Convalescent SARS-CoV-2 Patients

2021· preprint· en· W3156108146 sur OpenAlexaff
Grant A. Kay, Sophie I. Owen, Emanuele Giorgi, Christopher T. Williams, Stefanie K. Menzies, David J. Clark, Luís E. Cuevas, Benedict M O Davies, Nicholas M Eckersley, Grant L. Hughes, Daniela E. Kirwan, Sanjeev Krishna, Edward I. Patterson, Tim Planche, Henry M. Staines, Emily R. Adams

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesSt. George's, University of LondonJohn Black Charitable FoundationPublic Health EnglandRosetrees TrustNational Institute for Health Research Health Protection Research UnitNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of OxfordWellcome Trust
Mots-clésAntibodyVirologySevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)MedicineTiterImmunologyNeutralizationCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Immunoglobulin GImmune systemInternal medicineDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Severe acute respiratory coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has spread globally since its emergence in 2019. Most SARS-CoV-2 infections generate immune responses leading to rising levels of immunoglobulins (Ig) M, A and G which can be detected using diagnostic tests including enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA). Whilst implying previous SARS-CoV-2 infection, the detection of Ig by ELISA does not guarantee the presence of neutralising antibodies (NAb) that can prevent the virus infecting cells. Plaque reduction neutralisation tests (PRNT) detect NAb but are not amenable to mass testing as they take several days and require use of viable SARS-CoV-2 in high biocontainment laboratories. We evaluated the ability of IgG and IgM ELISAs targeting SARS-CoV-2 spike subunit 1 (S1) and nucleocapsid protein (NP) at predicting the presence and magnitude of NAb determined by PRNT. SARS-CoV-2 IgG ELISA correlated well with NAb and was highly sensitive (93.8% [95% CI 79.2–99.2]) and specific (88.9% [95% CI 51.8–99.7%]) at predicting the presence of NAb. There was not a strong correlation between IgM ELISA and PRNT result. IgG ELISA provides a useful, high throughput method of predicting the presence of neutralising antibodies, with higher ELISA results increasing the likelihood of having a greater NAb titre.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,086
Tête enseignante GPT0,432
Écart entre enseignants0,346 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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