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Enregistrement W3156280969 · doi:10.1038/s41467-021-21732-0

Differences in subcortico-cortical interactions identified from connectome and microcircuit models in autism

2021· article· en· W3156280969 sur OpenAlexafffund
Bo‐yong Park, Seok‐Jun Hong, Sofie L. Valk, Casey Paquola, Oualid Benkarim, Richard A. I. Bethlehem, Adriana Di Martino, Michael P. Milham, Alessandro Gozzi, B.T. Thomas Yeo, Jonathan Smallwood, Boris C. Bernhardt

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAutism Spectrum Disorder Research
Établissements canadiensQueen's UniversityMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNIH Office of the DirectorNational Human Genome Research InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCentre Azrieli de recherche sur l'autisme, Institut et Hôpital Neurologiques de MontréalNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteHospital for Sick ChildrenNational Research Foundation SingaporeNational Research Foundation of KoreaNational Cancer InstituteNational University of SingaporeNational Research FoundationCanada Research ChairsNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeFondazione TelethonSimons Foundation Autism Research InitiativeNational Institute on Drug AbuseNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionCommon FundMontreal Neurological Institute and HospitalSimons Foundation
Mots-clésConnectomeAutismNeuroscienceNeuroimagingSomatosensory systemHuman Connectome ProjectConnectomicsSensory processingPsychologySensory systemBiologyFunctional connectivityPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The pathophysiology of autism has been suggested to involve a combination of both macroscale connectome miswiring and microcircuit anomalies. Here, we combine connectome-wide manifold learning with biophysical simulation models to understand associations between global network perturbations and microcircuit dysfunctions in autism. We studied neuroimaging and phenotypic data in 47 individuals with autism and 37 typically developing controls obtained from the Autism Brain Imaging Data Exchange initiative. Our analysis establishes significant differences in structural connectome organization in individuals with autism relative to controls, with strong between-group effects in low-level somatosensory regions and moderate effects in high-level association cortices. Computational models reveal that the degree of macroscale anomalies is related to atypical increases of recurrent excitation/inhibition, as well as subcortical inputs into cortical microcircuits, especially in sensory and motor areas. Transcriptomic association analysis based on postmortem datasets identifies genes expressed in cortical and thalamic areas from childhood to young adulthood. Finally, supervised machine learning finds that the macroscale perturbations are associated with symptom severity scores on the Autism Diagnostic Observation Schedule. Together, our analyses suggest that atypical subcortico-cortical interactions are associated with both microcircuit and macroscale connectome differences in autism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,712
Score d'incertitude au seuil0,993

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations112
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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