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Enregistrement W3156669433 · doi:10.1136/gutjnl-2020-322595

Non-functional pancreatic neuroendocrine tumours: ATRX/DAXX and alternative lengthening of telomeres (ALT) are prognostically independent from ARX/PDX1 expression and tumour size

2021· article· en· W3156669433 sur OpenAlexaff
Wenzel M. Hackeng, Lodewijk A.A. Brosens, Joo Young Kim, Roderick J. O’Sullivan, You-Na Sung, Ta‐Chiang Liu, Dengfeng Cao, Michelle Heayn, Jacqueline A. Brosnan‐Cashman, Soyeon An, Folkert H.M. Morsink, Charlotte M. Heidsma, Gerlof D. Valk, Menno R. Vriens, Els Nieveen van Dijkum, G. Johan A. Offerhaus, Koen M.A. Dreijerink, Herbert J. Zeh, Amer H. Zureikat, Melissa E. Hogg, Kenneth Lee, David A. Geller, J. Wallis Marsh, Alessandro Paniccia, Melanie Ongchin, James F. Pingpank, Nathan Bahary, Muaz Aijazi, Randall E. Brand, Jennifer Chennat, Rohit Das, Kenneth Fasanella, Asif Khalid, Kevin McGrath, Savreet Sarkaria, Harkirat Singh, Adam Slivka, Michael A. Nalesnik, Xiaoli Han, Marina N. Nikiforova, Rita T. Lawlor, Andrea Mafficini, Boris Rusev, Vincenzo Corbo, Claudio Luchini, Samantha Bersani, Antonio Pea, Sara Cingarlini, Luca Landoni, Roberto Salvia, Massimo Milione, Michèle Milella, Aldo Scarpa, Seung‐Mo Hong, Christopher M. Heaphy, Aatur D. Singhi

Notice bibliographique

RevueGut · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroendocrine Tumor Research Advances
Établissements canadiensUniversity Hospital Foundation
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNorth American Neuroendocrine Tumor SocietyNeuroendocrine Tumor Research FoundationNational Research Foundation of KoreaMinistero della SaluteNational Cancer InstituteNational Research FoundationMaag Lever Darm StichtingAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroUniversity of PittsburghNational Institutes of HealthFondazione Cassa di Risparmio di Verona Vicenza Belluno e Ancona
Mots-clésATRXDeath-associated protein 6PDX1Neuroendocrine tumorsBiologyCancer researchInternal medicineOncologyPathologyMedicineEndocrinologyGeneNuclear proteinTranscription factorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Recent studies have found aristaless-related homeobox gene (ARX)/pancreatic and duodenal homeobox 1 (PDX1), alpha-thalassemia/mental retardation X-linked (ATRX)/death domain-associated protein (DAXX) and alternative lengthening of telomeres (ALT) to be promising prognostic biomarkers for non-functional pancreatic neuroendocrine tumours (NF-PanNETs). However, they have not been comprehensively evaluated, especially among small NF-PanNETs (≤2.0 cm). Moreover, their status in neuroendocrine tumours (NETs) from other sites remains unknown. DESIGN: An international cohort of 1322 NETs was evaluated by immunolabelling for ARX/PDX1 and ATRX/DAXX, and telomere-specific fluorescence in situ hybridisation for ALT. This cohort included 561 primary NF-PanNETs, 107 NF-PanNET metastases and 654 primary, non-pancreatic non-functional NETs and NET metastases. The results were correlated with numerous clinicopathological features including relapse-free survival (RFS). RESULTS: ATRX/DAXX loss and ALT were associated with several adverse prognostic findings and distant metastasis/recurrence (p<0.001). The 5-year RFS rates for patients with ATRX/DAXX-negative and ALT-positive NF-PanNETs were 40% and 42% as compared with 85% and 86% for wild-type NF-PanNETs (p<0.001 and p<0.001). Shorter 5-year RFS rates for ≤2.0 cm NF-PanNETs patients were also seen with ATRX/DAXX loss (65% vs 92%, p=0.003) and ALT (60% vs 93%, p<0.001). By multivariate analysis, ATRX/DAXX and ALT status were independent prognostic factors for RFS. Conversely, classifying NF-PanNETs by ARX/PDX1 expression did not independently correlate with RFS. Except for 4% of pulmonary carcinoids, ATRX/DAXX loss and ALT were only identified in primary (25% and 29%) and NF-PanNET metastases (62% and 71%). CONCLUSIONS: ATRX/DAXX and ALT should be considered in the prognostic evaluation of NF-PanNETs including ≤2.0 cm tumours, and are highly specific for pancreatic origin among NET metastases of unknown primary.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations151
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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