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Enregistrement W3156874173 · doi:10.1073/pnas.2016698118

A complement factor H homolog, heparan sulfation, and syndecan maintain inversin compartment boundaries in <i>C. elegans</i> cilia

2021· article· en· W3156874173 sur OpenAlexafffund
Natalie Acker, Harold E. Smith, Claire Devine, Sharon L. Oltjen, Sofia Tsiropoulou, Zeljka Smit‐McBride, Karen I. Lange, Oliver E. Blacque, Joanne Aiko Matsubara, Andrew Gordus, Andy Golden, Bruce E. Vogel

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Diseases and Treatments
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Eye InstituteOffice of Extramural Research, National Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésCiliumBiologyCell biologyABCA4Retinal degenerationCiliogenesisCaenorhabditis elegansHeparan sulfateCompartment (ship)MutationGeneticsGeneCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance Mutations in complement factor H (CFH) binding sites for heparan sulfate (HS) increase risk for age-related macular degeneration (AMD), but the roles of CFH and HS in disease pathogenesis remain unclear. Here, we find that a CFH homolog, HS modification, and the HS proteoglycan syndecan/SDN-1 have roles in maintaining cilia compartment boundaries in the sensory neurons of aging C. elegans adults. The role of CFH in cilia compartment boundaries is conserved in vertebrate photoreceptors, suggesting that structural defects in photoreceptor cilia make a contribution to AMD progression in patients with CFH mutations that has not been appreciated previously.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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