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Enregistrement W3157083779 · doi:10.1002/9781119545958.ch8

Complex Regulation of Proanthocyanidin Biosynthesis in Plants by R2R3 MYB Activators and Repressors

2021· other· en· W3157083779 sur OpenAlexaff
Dawei Ma, C. Peter Constabel

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMYBRepressorPhenylpropanoidStructural geneFlavonoid biosynthesisTranscription factorBiologyTranscriptional regulationRegulation of gene expressionCell biologyGeneBiochemistryGeneticsGene expressionBiosynthesisTranscriptomeMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MYB transcription factors are central players in the regulation of phenylpropanoid and flavonoid metabolism. In proanthocyanidin and anthocyanin biosynthesis, MYBs act within a MBW (MYB-bHLH-WD40) complex. However, the MYB provides the specificity and ultimately determines where in the plant these pathways are activated. While work on the transcriptional regulation of proanthocyanidin biosynthesis in Arabidopsis seed coat has been instrumental in the discovery of MYB transcription factors, research in other plants such as grapevine and poplar has also made substantial contributions. In these systems, several types of MYB transcriptional activators of proanthocyanidin biosynthesis in poplar have been described, which in turn induce the expression of MYB repressors. The role of the MYB repressors may be to help modulate stress-induced PA synthesis, or to fine-tune flavonoid and phenylpropanoid metabolism. Characterizing both types of MYB genes via transgenic overexpression and promoter activation assays in transiently transformed cells has allowed us to construct a model for this gene regulatory network of MYB activators and repressors for regulation of proanthocyanidins in poplar. A long-term aim is to understand the mechanisms of repressor action, and to identify the linkages to upstream signals or environmental stimuli that induce proanthocyanidin accumulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,144
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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